Protein–RNA interactions for Protein: G3X9A2

Krtap24-1, Keratin-associated protein 24-1, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap24-1G3X9A2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Krtap24-1G3X9A2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Krtap24-1G3X9A2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Krtap24-1G3X9A2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,3■■□□□ 1,8
Krtap24-1G3X9A2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Krtap24-1G3X9A2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Krtap24-1G3X9A2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Krtap24-1G3X9A2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Krtap24-1G3X9A2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Krtap24-1G3X9A2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Krtap24-1G3X9A2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Krtap24-1G3X9A2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Krtap24-1G3X9A2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Krtap24-1G3X9A2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Krtap24-1G3X9A2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Krtap24-1G3X9A2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Krtap24-1G3X9A2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Krtap24-1G3X9A2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Krtap24-1G3X9A2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Krtap24-1G3X9A2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Krtap24-1G3X9A2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Krtap24-1G3X9A2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Krtap24-1G3X9A2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Krtap24-1G3X9A2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Krtap24-1G3X9A2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Krtap24-1G3X9A2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Krtap24-1G3X9A2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Krtap24-1G3X9A2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Krtap24-1G3X9A2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Krtap24-1G3X9A2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Krtap24-1G3X9A2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Krtap24-1G3X9A2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Krtap24-1G3X9A2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Krtap24-1G3X9A2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Krtap24-1G3X9A2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Krtap24-1G3X9A2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Krtap24-1G3X9A2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Krtap24-1G3X9A2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Krtap24-1G3X9A2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Krtap24-1G3X9A2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Krtap24-1G3X9A2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Krtap24-1G3X9A2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Krtap24-1G3X9A2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Krtap24-1G3X9A2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Krtap24-1G3X9A2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Krtap24-1G3X9A2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,89■■□□□ 1,26
Krtap24-1G3X9A2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Krtap24-1G3X9A2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,79■■□□□ 1,24
Krtap24-1G3X9A2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Krtap24-1G3X9A2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,69■■□□□ 1,22
Krtap24-1G3X9A2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,69■■□□□ 1,22
Krtap24-1G3X9A2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Krtap24-1G3X9A2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Krtap24-1G3X9A2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Krtap24-1G3X9A2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Krtap24-1G3X9A2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,58■■□□□ 1,21
Krtap24-1G3X9A2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Krtap24-1G3X9A2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
Krtap24-1G3X9A2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Krtap24-1G3X9A2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Krtap24-1G3X9A2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Krtap24-1G3X9A2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Krtap24-1G3X9A2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Krtap24-1G3X9A2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Krtap24-1G3X9A2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,39■■□□□ 1,17
Krtap24-1G3X9A2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,38■■□□□ 1,17
Krtap24-1G3X9A2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,38■■□□□ 1,17
Krtap24-1G3X9A2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Krtap24-1G3X9A2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,34■■□□□ 1,17
Krtap24-1G3X9A2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Krtap24-1G3X9A2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Krtap24-1G3X9A2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Krtap24-1G3X9A2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Krtap24-1G3X9A2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Krtap24-1G3X9A2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Krtap24-1G3X9A2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Krtap24-1G3X9A2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Krtap24-1G3X9A2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Krtap24-1G3X9A2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Krtap24-1G3X9A2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Krtap24-1G3X9A2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Krtap24-1G3X9A2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Krtap24-1G3X9A2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Krtap24-1G3X9A2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Krtap24-1G3X9A2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Krtap24-1G3X9A2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Krtap24-1G3X9A2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Krtap24-1G3X9A2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Krtap24-1G3X9A2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
Krtap24-1G3X9A2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Krtap24-1G3X9A2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Krtap24-1G3X9A2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Krtap24-1G3X9A2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Krtap24-1G3X9A2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Krtap24-1G3X9A2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Krtap24-1G3X9A2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Krtap24-1G3X9A2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Krtap24-1G3X9A2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Krtap24-1G3X9A2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Krtap24-1G3X9A2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms