Protein–RNA interactions for Protein: G3X9A2

Krtap24-1, Keratin-associated protein 24-1, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap24-1G3X9A2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Krtap24-1G3X9A2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Krtap24-1G3X9A2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Krtap24-1G3X9A2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Krtap24-1G3X9A2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Krtap24-1G3X9A2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Krtap24-1G3X9A2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krtap24-1G3X9A2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krtap24-1G3X9A2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krtap24-1G3X9A2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Krtap24-1G3X9A2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krtap24-1G3X9A2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krtap24-1G3X9A2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krtap24-1G3X9A2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Krtap24-1G3X9A2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krtap24-1G3X9A2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krtap24-1G3X9A2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krtap24-1G3X9A2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krtap24-1G3X9A2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krtap24-1G3X9A2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krtap24-1G3X9A2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krtap24-1G3X9A2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krtap24-1G3X9A2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krtap24-1G3X9A2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krtap24-1G3X9A2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krtap24-1G3X9A2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Krtap24-1G3X9A2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Krtap24-1G3X9A2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krtap24-1G3X9A2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krtap24-1G3X9A2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krtap24-1G3X9A2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krtap24-1G3X9A2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krtap24-1G3X9A2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap24-1G3X9A2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krtap24-1G3X9A2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krtap24-1G3X9A2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap24-1G3X9A2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krtap24-1G3X9A2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krtap24-1G3X9A2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krtap24-1G3X9A2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krtap24-1G3X9A2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krtap24-1G3X9A2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krtap24-1G3X9A2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krtap24-1G3X9A2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krtap24-1G3X9A2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap24-1G3X9A2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krtap24-1G3X9A2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krtap24-1G3X9A2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krtap24-1G3X9A2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krtap24-1G3X9A2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krtap24-1G3X9A2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krtap24-1G3X9A2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krtap24-1G3X9A2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krtap24-1G3X9A2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krtap24-1G3X9A2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krtap24-1G3X9A2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap24-1G3X9A2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap24-1G3X9A2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap24-1G3X9A2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krtap24-1G3X9A2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krtap24-1G3X9A2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap24-1G3X9A2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap24-1G3X9A2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap24-1G3X9A2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap24-1G3X9A2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap24-1G3X9A2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap24-1G3X9A2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap24-1G3X9A2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap24-1G3X9A2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap24-1G3X9A2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap24-1G3X9A2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krtap24-1G3X9A2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krtap24-1G3X9A2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krtap24-1G3X9A2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krtap24-1G3X9A2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krtap24-1G3X9A2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krtap24-1G3X9A2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krtap24-1G3X9A2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krtap24-1G3X9A2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krtap24-1G3X9A2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap24-1G3X9A2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap24-1G3X9A2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap24-1G3X9A2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap24-1G3X9A2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap24-1G3X9A2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap24-1G3X9A2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krtap24-1G3X9A2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krtap24-1G3X9A2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krtap24-1G3X9A2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Krtap24-1G3X9A2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krtap24-1G3X9A2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krtap24-1G3X9A2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krtap24-1G3X9A2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krtap24-1G3X9A2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krtap24-1G3X9A2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krtap24-1G3X9A2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krtap24-1G3X9A2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap24-1G3X9A2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krtap24-1G3X9A2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krtap24-1G3X9A2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms