Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Sigmar1O55242 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Sigmar1O55242 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Sigmar1O55242 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Sigmar1O55242 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Sigmar1O55242 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Sigmar1O55242 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Sigmar1O55242 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Sigmar1O55242 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Sigmar1O55242 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Sigmar1O55242 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Sigmar1O55242 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Sigmar1O55242 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Sigmar1O55242 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Sigmar1O55242 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Sigmar1O55242 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Sigmar1O55242 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Sigmar1O55242 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Sigmar1O55242 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Sigmar1O55242 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Sigmar1O55242 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Sigmar1O55242 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Sigmar1O55242 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Sigmar1O55242 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Sigmar1O55242 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20,23■□□□□ 0,83
Sigmar1O55242 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Sigmar1O55242 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,82
Sigmar1O55242 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Sigmar1O55242 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Sigmar1O55242 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Sigmar1O55242 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Sigmar1O55242 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Sigmar1O55242 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Sigmar1O55242 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Sigmar1O55242 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Sigmar1O55242 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Sigmar1O55242 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Sigmar1O55242 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19,77■□□□□ 0,76
Sigmar1O55242 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Sigmar1O55242 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Sigmar1O55242 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,71■□□□□ 0,75
Sigmar1O55242 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Sigmar1O55242 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Sigmar1O55242 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Sigmar1O55242 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Sigmar1O55242 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Sigmar1O55242 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,52■□□□□ 0,72
Sigmar1O55242 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Sigmar1O55242 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Sigmar1O55242 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Sigmar1O55242 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Sigmar1O55242 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,41■□□□□ 0,7
Sigmar1O55242 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Sigmar1O55242 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,7
Sigmar1O55242 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Sigmar1O55242 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Sigmar1O55242 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Sigmar1O55242 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
Sigmar1O55242 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Sigmar1O55242 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19,2■□□□□ 0,66
Sigmar1O55242 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Sigmar1O55242 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Sigmar1O55242 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Sigmar1O55242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,14■□□□□ 0,66
Sigmar1O55242 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Sigmar1O55242 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Sigmar1O55242 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Sigmar1O55242 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,12■□□□□ 0,65
Sigmar1O55242 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Sigmar1O55242 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Sigmar1O55242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Sigmar1O55242 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Sigmar1O55242 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Sigmar1O55242 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Sigmar1O55242 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Sigmar1O55242 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Sigmar1O55242 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Sigmar1O55242 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Sigmar1O55242 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Sigmar1O55242 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Sigmar1O55242 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Sigmar1O55242 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Sigmar1O55242 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Sigmar1O55242 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Sigmar1O55242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Sigmar1O55242 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Sigmar1O55242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Sigmar1O55242 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Sigmar1O55242 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Sigmar1O55242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Sigmar1O55242 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Sigmar1O55242 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18,7■□□□□ 0,58
Sigmar1O55242 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Sigmar1O55242 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18,67■□□□□ 0,58
Sigmar1O55242 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Sigmar1O55242 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,65■□□□□ 0,58
Sigmar1O55242 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Sigmar1O55242 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Sigmar1O55242 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,6■□□□□ 0,57
Sigmar1O55242 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18,59■□□□□ 0,57
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