RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm815Q3UWS2 115 aa16■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam110dQ80X91 271 aa16■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ifi27l2aQ8R412 90 aa16■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp6v0e2Q91XE7 81 aa16■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav13d-1A0A075B606 110 aa16■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdip1Q9DB75 208 aa16■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa15.99■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9513B3GLJ6 99 aa15.99■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm3443F7CCV5 94 aa15.99■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dmbt1Q60997 2085 aa15.99■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CubnQ9JLB4 3623 aa15.99■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbmy1bQ60990 380 aa15.99■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Notch3Q61982 2318 aa15.99■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa15.98■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9887F6RFI0 207 aa15.98■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10135F6TEE5 83 aa15.98■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cox17P56394 63 aa15.98■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm5089A1L3C8 106 aa15.97■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8439G3UWA7 96 aa15.97■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smim10l1A0A087WNQ7 89 aa15.97■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ColqO35348 457 aa15.97■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fgfbp3Q1HCM0 245 aa15.97■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P01738 130 aa15.96■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav7d-3Q5R1I1 112 aa15.96■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BC048562Q80ZQ7 204 aa15.96■□□□□ 0.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trdv5A0A075B661 115 aa15.96■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm5819E9PZ96 154 aa15.96■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ly6gP35461 111 aa15.96■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf183Q8QZS5 190 aa15.95■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fgf23Q9EPC2 251 aa15.95■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phlda3Q9WV95 125 aa15.95■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa15.95■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hectd1Q69ZR2 2618 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cryba4Q9JJV0 196 aa15.94■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm11444F6QMA6 170 aa15.93■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpl32-psP17932 135 aa15.92■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cfc1P97766 202 aa15.92■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9747Q810H1 104 aa15.92■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 March3Q8BRX9 218 aa15.92■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spink10Q8CAC8 162 aa15.92■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7849D3YX03 116 aa15.91■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnase1P00683 149 aa15.91■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv1-72P01751 139 aa15.91■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdzd2E9Q1M1 2796 aa15.9■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa15.9■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spata45Q9CVW4 97 aa15.9■□□□□ 0.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Xirp2Q4U4S6 3784 aa15.89■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm6793B2RXM2 351 aa15.89■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q9DAQ5 155 aa15.89■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa15.88■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igfn1Q3KNY0 2849 aa15.88■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gatd1Q8BFQ8 220 aa15.87■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10322F7D7I4 111 aa15.86■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BsnO88737 3942 aa15.86■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankrd17Q99NH0 2603 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10542F6XDR3 90 aa15.86■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Srp14P16254 110 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcp4P63054 62 aa15.86■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9936Q8C864 160 aa15.86■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lgals4Q8K419 326 aa15.86■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PrlhG3UWC3 86 aa15.85■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem101Q91VP7 257 aa15.85■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q99M08 65 aa15.85■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm11020F6ZGD5 61 aa15.84■□□□□ 0.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm29423A0A087WRM1 55 aa15.83■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Glrp1E9Q9S8 174 aa15.83■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10300Q8C8P7 189 aa15.83■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lypd5Q9D7Z7 256 aa15.82■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7075D3Z497 112 aa15.82■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spink1P09036 80 aa15.82■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17472A0A075B683 117 aa15.81■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P01896 185 aa15.81■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rif1Q6PR54 2419 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4ebp3Q80VV3 101 aa15.81■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm4861Q8C5A4 106 aa15.81■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P01729 129 aa15.8■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa15.8■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv4-79A0A075B5L8 119 aa15.79■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf152Q8BG47 203 aa15.79■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P01823 113 aa15.79■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp5g3P56384 141 aa15.79■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cks1bP61025 79 aa15.79■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defb42Q8BVB5 75 aa15.78■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prelid3aQ8VE85 172 aa15.78■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa15.78■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RetnQ99P87 114 aa15.78■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa15.77■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wnk1P83741 2377 aa15.77■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CenpwQ3URR0 86 aa15.77■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shisa2Q8QZV2 295 aa15.77■□□□□ 0.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 H1fxQ80ZM5 188 aa15.76■□□□□ 0.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FlnaQ8BTM8 2647 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa15.76■□□□□ 0.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Timm17bQ9Z0V7 172 aa15.76■□□□□ 0.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defb26Q30KN7 186 aa15.75■□□□□ 0.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4ebp1Q60876 117 aa15.75■□□□□ 0.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nop10Q9CQS2 64 aa15.75■□□□□ 0.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cd164l2Q9D6W7 172 aa15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.3 ms