Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB75

Cdip1, Cell death-inducing p53-target protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdip1Q9DB75 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Cdip1Q9DB75 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Cdip1Q9DB75 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Cdip1Q9DB75 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,5■■□□□ 1,03
Cdip1Q9DB75 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Cdip1Q9DB75 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Cdip1Q9DB75 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Cdip1Q9DB75 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Cdip1Q9DB75 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cdip1Q9DB75 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Cdip1Q9DB75 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Cdip1Q9DB75 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cdip1Q9DB75 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cdip1Q9DB75 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Cdip1Q9DB75 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cdip1Q9DB75 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Cdip1Q9DB75 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Cdip1Q9DB75 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,19■□□□□ 0,82
Cdip1Q9DB75 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cdip1Q9DB75 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cdip1Q9DB75 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cdip1Q9DB75 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cdip1Q9DB75 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cdip1Q9DB75 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cdip1Q9DB75 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cdip1Q9DB75 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cdip1Q9DB75 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cdip1Q9DB75 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cdip1Q9DB75 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cdip1Q9DB75 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cdip1Q9DB75 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cdip1Q9DB75 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cdip1Q9DB75 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Cdip1Q9DB75 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Cdip1Q9DB75 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Cdip1Q9DB75 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Cdip1Q9DB75 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Cdip1Q9DB75 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,34■□□□□ 0,69
Cdip1Q9DB75 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Cdip1Q9DB75 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19,26■□□□□ 0,67
Cdip1Q9DB75 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,25■□□□□ 0,67
Cdip1Q9DB75 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,22■□□□□ 0,67
Cdip1Q9DB75 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Cdip1Q9DB75 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Cdip1Q9DB75 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Cdip1Q9DB75 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Cdip1Q9DB75 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Cdip1Q9DB75 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Cdip1Q9DB75 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Cdip1Q9DB75 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Cdip1Q9DB75 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Cdip1Q9DB75 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
Cdip1Q9DB75 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Cdip1Q9DB75 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Cdip1Q9DB75 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Cdip1Q9DB75 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Cdip1Q9DB75 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Cdip1Q9DB75 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,93■□□□□ 0,62
Cdip1Q9DB75 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18,89■□□□□ 0,61
Cdip1Q9DB75 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,61
Cdip1Q9DB75 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Cdip1Q9DB75 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Cdip1Q9DB75 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Cdip1Q9DB75 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Cdip1Q9DB75 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Cdip1Q9DB75 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cdip1Q9DB75 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Cdip1Q9DB75 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Cdip1Q9DB75 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
Cdip1Q9DB75 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,64■□□□□ 0,57
Cdip1Q9DB75 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,63■□□□□ 0,57
Cdip1Q9DB75 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18,63■□□□□ 0,57
Cdip1Q9DB75 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,63■□□□□ 0,57
Cdip1Q9DB75 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18,61■□□□□ 0,57
Cdip1Q9DB75 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,57
Cdip1Q9DB75 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
Cdip1Q9DB75 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18,54■□□□□ 0,56
Cdip1Q9DB75 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18,53■□□□□ 0,56
Cdip1Q9DB75 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Cdip1Q9DB75 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Cdip1Q9DB75 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Cdip1Q9DB75 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Cdip1Q9DB75 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
Cdip1Q9DB75 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18,4■□□□□ 0,54
Cdip1Q9DB75 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
Cdip1Q9DB75 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18,39■□□□□ 0,53
Cdip1Q9DB75 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
Cdip1Q9DB75 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
Cdip1Q9DB75 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,33■□□□□ 0,52
Cdip1Q9DB75 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Cdip1Q9DB75 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Cdip1Q9DB75 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Cdip1Q9DB75 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
Cdip1Q9DB75 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Cdip1Q9DB75 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Cdip1Q9DB75 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Cdip1Q9DB75 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18,23■□□□□ 0,51
Cdip1Q9DB75 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Cdip1Q9DB75 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,23■□□□□ 0,51
Cdip1Q9DB75 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,5 ms