Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf183Q8QZS5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf183Q8QZS5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf183Q8QZS5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf183Q8QZS5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf183Q8QZS5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf183Q8QZS5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf183Q8QZS5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf183Q8QZS5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf183Q8QZS5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf183Q8QZS5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf183Q8QZS5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf183Q8QZS5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf183Q8QZS5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf183Q8QZS5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf183Q8QZS5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf183Q8QZS5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf183Q8QZS5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf183Q8QZS5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf183Q8QZS5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf183Q8QZS5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf183Q8QZS5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf183Q8QZS5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf183Q8QZS5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf183Q8QZS5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf183Q8QZS5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf183Q8QZS5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf183Q8QZS5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf183Q8QZS5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf183Q8QZS5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf183Q8QZS5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf183Q8QZS5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf183Q8QZS5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf183Q8QZS5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf183Q8QZS5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf183Q8QZS5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf183Q8QZS5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf183Q8QZS5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf183Q8QZS5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf183Q8QZS5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf183Q8QZS5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf183Q8QZS5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf183Q8QZS5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf183Q8QZS5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf183Q8QZS5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf183Q8QZS5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf183Q8QZS5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf183Q8QZS5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf183Q8QZS5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf183Q8QZS5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf183Q8QZS5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf183Q8QZS5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf183Q8QZS5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf183Q8QZS5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf183Q8QZS5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf183Q8QZS5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf183Q8QZS5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf183Q8QZS5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf183Q8QZS5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf183Q8QZS5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf183Q8QZS5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf183Q8QZS5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf183Q8QZS5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf183Q8QZS5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf183Q8QZS5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf183Q8QZS5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf183Q8QZS5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf183Q8QZS5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf183Q8QZS5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf183Q8QZS5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf183Q8QZS5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf183Q8QZS5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf183Q8QZS5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf183Q8QZS5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf183Q8QZS5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf183Q8QZS5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf183Q8QZS5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf183Q8QZS5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf183Q8QZS5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf183Q8QZS5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf183Q8QZS5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf183Q8QZS5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf183Q8QZS5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf183Q8QZS5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf183Q8QZS5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf183Q8QZS5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf183Q8QZS5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf183Q8QZS5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf183Q8QZS5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf183Q8QZS5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf183Q8QZS5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf183Q8QZS5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf183Q8QZS5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf183Q8QZS5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf183Q8QZS5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf183Q8QZS5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf183Q8QZS5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf183Q8QZS5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf183Q8QZS5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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