RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000209578.1

Ebf3-205, Transcript of Transcription factor COE3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ebf3, Length 1,863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Cox8bP48772 70 aa7.18□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Dand5Q76LW6 185 aa7.18□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 A530064D06RikQ8BNV8 229 aa7.18□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Malsu1Q9CWV0 228 aa7.18□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Snai3Q9QY31 287 aa7.18□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Nat8f4G5E8L3 226 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Scgb1b3J3QJY4 93 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Cmc4Q61908 68 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Cysltr1Q99JA4 352 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 OtorQ9JIE3 128 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Pkd1l1Q8R526 2615 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Scgb1b11A0A087WQJ0 93 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Tcl1b4P56844 120 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 P84751 237 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Trav7-2Q5R1I3 112 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Ammecr1lQ8JZZ6 310 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Chchd7Q8K2Q5 85 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Rnf114Q9ET26 229 aa7.17□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Trav6n-6A0A075B6B2 114 aa7.16□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Vsig4F6TUL9 280 aa7.16□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gata3P23772 443 aa7.16□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gng4P50153 75 aa7.16□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Cox17P56394 63 aa7.16□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Pmis2Q497Q9 96 aa7.16□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Trappc1Q5NCF2 145 aa7.16□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Leap2Q91V13 76 aa7.16□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa7.15□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Lgals6O54891 301 aa7.15□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Ca1P13634 261 aa7.15□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 PlnP61014 52 aa7.15□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Polr2kQ63871 58 aa7.15□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 CtrlQ9ER05 264 aa7.15□□□□□ -1.26
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gm7257D3YX25 99 aa7.15□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 P06329 120 aa7.15□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 P0C913 63 aa7.15□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Bud31Q6PGH1 103 aa7.15□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Snx22Q8C084 192 aa7.15□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Lyzl4Q9D925 145 aa7.15□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Klk11Q9QYN3 276 aa7.15□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gm4707V9GXN5 68 aa7.15□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa7.14□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa7.14□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 B9d2Q3UK10 175 aa7.14□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Ormdl2Q9CQZ0 153 aa7.14□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Q9DAA3 117 aa7.14□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Ighv1-85A0A075B5Y6 117 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Defa35E9QLQ1 93 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gm5629P06327 117 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 VwfQ8CIZ8 2813 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Tenm2Q9WTS5 2764 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Esp3J3QN49 87 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Rpl32P62911 135 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Fgfbp3Q1HCM0 245 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Ndufa3Q9CQ91 84 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Hspb8Q9JK92 196 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Spry2Q9QXV8 315 aa7.13□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Ceacam15A0A0B4J1L0 234 aa7.12□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gm9887F6RFI0 207 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 OdaphJ3QNT8 126 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gm28044L7N1X0 119 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 CrxO54751 299 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 TtrP07309 147 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Phxr5P08399 672 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gata1P17679 413 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Atp5lQ9CPQ8 103 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Ighv6-7A0A0A6YWU3 119 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gm10322F7D7I4 111 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 P01794 123 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 TcraP01849 138 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Rpl39P62892 51 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gpha2Q925Q5 128 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Phlda3Q9WV95 125 aa7.11□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Dnah6E9Q0B6 4144 aa7.1□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa7.1□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gm10604Q3V0X7 143 aa7.1□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Tspo2Q9CRZ8 162 aa7.1□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Dnah10D3YYQ8 4591 aa7.1□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Trav9d-3A0A075B695 113 aa7.09□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 P01745 121 aa7.09□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Ndufc2Q9CQ54 120 aa7.09□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Tex48Q9DA81 110 aa7.09□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 EsdQ9R0P3 282 aa7.09□□□□□ -1.27
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gpx1P11352 201 aa7.09□□□□□ -1.28
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Gng7Q61016 68 aa7.09□□□□□ -1.28
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Higd2aQ9CQJ1 106 aa7.09□□□□□ -1.28
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Kmt2aP55200 3966 aa7.08□□□□□ -1.28
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Trav13d-1A0A075B606 110 aa7.08□□□□□ -1.28
Ebf3-205ENSMUST00000209578 Igkv4-54A0A0G2JES9 117 aa7.08□□□□□ -1.28
Ebf3-205ENSMUST00000209578 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa7.08□□□□□ -1.28
Ebf3-205ENSMUST00000209578 AponG3X9D6 251 aa7.08□□□□□ -1.28
Ebf3-205ENSMUST00000209578 NpsP0C0P8 89 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.4 ms