Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y6

Ighv1-85, Immunoglobulin heavy variable 1-85 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Ighv1-85A0A075B5Y6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ighv1-85A0A075B5Y6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Ighv1-85A0A075B5Y6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ighv1-85A0A075B5Y6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ighv1-85A0A075B5Y6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ighv1-85A0A075B5Y6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ighv1-85A0A075B5Y6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,56■■□□□ 1,2
Ighv1-85A0A075B5Y6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ighv1-85A0A075B5Y6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ighv1-85A0A075B5Y6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ighv1-85A0A075B5Y6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,11■■□□□ 1,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
Ighv1-85A0A075B5Y6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Ighv1-85A0A075B5Y6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ighv1-85A0A075B5Y6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ighv1-85A0A075B5Y6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,61■■□□□ 1,05
Ighv1-85A0A075B5Y6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Ighv1-85A0A075B5Y6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,33■■□□□ 1
Ighv1-85A0A075B5Y6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Ighv1-85A0A075B5Y6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ighv1-85A0A075B5Y6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ighv1-85A0A075B5Y6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ighv1-85A0A075B5Y6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ighv1-85A0A075B5Y6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
Ighv1-85A0A075B5Y6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ighv1-85A0A075B5Y6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ighv1-85A0A075B5Y6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ighv1-85A0A075B5Y6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ighv1-85A0A075B5Y6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ighv1-85A0A075B5Y6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ighv1-85A0A075B5Y6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,67■□□□□ 0,9
Ighv1-85A0A075B5Y6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Ighv1-85A0A075B5Y6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Ighv1-85A0A075B5Y6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Ighv1-85A0A075B5Y6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ighv1-85A0A075B5Y6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ighv1-85A0A075B5Y6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ighv1-85A0A075B5Y6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ighv1-85A0A075B5Y6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ighv1-85A0A075B5Y6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Ighv1-85A0A075B5Y6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,36■□□□□ 0,85
Ighv1-85A0A075B5Y6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Ighv1-85A0A075B5Y6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Ighv1-85A0A075B5Y6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Ighv1-85A0A075B5Y6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Ighv1-85A0A075B5Y6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Ighv1-85A0A075B5Y6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Ighv1-85A0A075B5Y6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Ighv1-85A0A075B5Y6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Ighv1-85A0A075B5Y6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Ighv1-85A0A075B5Y6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ighv1-85A0A075B5Y6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Ighv1-85A0A075B5Y6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Ighv1-85A0A075B5Y6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ighv1-85A0A075B5Y6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ighv1-85A0A075B5Y6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ighv1-85A0A075B5Y6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ighv1-85A0A075B5Y6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ighv1-85A0A075B5Y6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ighv1-85A0A075B5Y6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ighv1-85A0A075B5Y6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,84■□□□□ 0,77
Ighv1-85A0A075B5Y6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Ighv1-85A0A075B5Y6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Ighv1-85A0A075B5Y6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Ighv1-85A0A075B5Y6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Ighv1-85A0A075B5Y6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,77■□□□□ 0,76
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Ighv1-85A0A075B5Y6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
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