Protein–RNA interactions for Protein: G5E8L3

Nat8f4, MCG128680, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nat8f4G5E8L3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Nat8f4G5E8L3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Nat8f4G5E8L3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
Nat8f4G5E8L3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Nat8f4G5E8L3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Nat8f4G5E8L3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Nat8f4G5E8L3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
Nat8f4G5E8L3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Nat8f4G5E8L3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Nat8f4G5E8L3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Nat8f4G5E8L3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Nat8f4G5E8L3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Nat8f4G5E8L3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Nat8f4G5E8L3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Nat8f4G5E8L3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Nat8f4G5E8L3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Nat8f4G5E8L3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Nat8f4G5E8L3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Nat8f4G5E8L3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Nat8f4G5E8L3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Nat8f4G5E8L3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Nat8f4G5E8L3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Nat8f4G5E8L3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Nat8f4G5E8L3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
Nat8f4G5E8L3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Nat8f4G5E8L3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Nat8f4G5E8L3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Nat8f4G5E8L3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Nat8f4G5E8L3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,76■■□□□ 1,07
Nat8f4G5E8L3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Nat8f4G5E8L3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Nat8f4G5E8L3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Nat8f4G5E8L3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Nat8f4G5E8L3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Nat8f4G5E8L3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Nat8f4G5E8L3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Nat8f4G5E8L3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Nat8f4G5E8L3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Nat8f4G5E8L3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Nat8f4G5E8L3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Nat8f4G5E8L3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Nat8f4G5E8L3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Nat8f4G5E8L3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
Nat8f4G5E8L3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Nat8f4G5E8L3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Nat8f4G5E8L3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Nat8f4G5E8L3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Nat8f4G5E8L3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Nat8f4G5E8L3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Nat8f4G5E8L3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Nat8f4G5E8L3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Nat8f4G5E8L3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
Nat8f4G5E8L3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Nat8f4G5E8L3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Nat8f4G5E8L3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Nat8f4G5E8L3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Nat8f4G5E8L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Nat8f4G5E8L3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Nat8f4G5E8L3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Nat8f4G5E8L3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Nat8f4G5E8L3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Nat8f4G5E8L3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Nat8f4G5E8L3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Nat8f4G5E8L3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Nat8f4G5E8L3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Nat8f4G5E8L3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Nat8f4G5E8L3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Nat8f4G5E8L3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Nat8f4G5E8L3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Nat8f4G5E8L3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Nat8f4G5E8L3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Nat8f4G5E8L3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Nat8f4G5E8L3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Nat8f4G5E8L3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Nat8f4G5E8L3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Nat8f4G5E8L3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Nat8f4G5E8L3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,56■□□□□ 0,88
Nat8f4G5E8L3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
Nat8f4G5E8L3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Nat8f4G5E8L3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Nat8f4G5E8L3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Nat8f4G5E8L3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Nat8f4G5E8L3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Nat8f4G5E8L3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Nat8f4G5E8L3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Nat8f4G5E8L3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,38■□□□□ 0,85
Nat8f4G5E8L3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Nat8f4G5E8L3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Nat8f4G5E8L3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,33■□□□□ 0,85
Nat8f4G5E8L3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Nat8f4G5E8L3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Nat8f4G5E8L3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Nat8f4G5E8L3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Nat8f4G5E8L3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Nat8f4G5E8L3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Nat8f4G5E8L3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,83
Nat8f4G5E8L3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Nat8f4G5E8L3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Nat8f4G5E8L3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Nat8f4G5E8L3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
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