Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Lgals6O54891 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Lgals6O54891 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Lgals6O54891 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
Lgals6O54891 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,42■■□□□ 1,34
Lgals6O54891 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Lgals6O54891 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Lgals6O54891 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Lgals6O54891 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Lgals6O54891 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Lgals6O54891 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Lgals6O54891 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Lgals6O54891 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Lgals6O54891 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Lgals6O54891 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Lgals6O54891 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Lgals6O54891 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
Lgals6O54891 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Lgals6O54891 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Lgals6O54891 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Lgals6O54891 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
Lgals6O54891 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Lgals6O54891 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Lgals6O54891 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Lgals6O54891 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Lgals6O54891 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Lgals6O54891 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Lgals6O54891 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,3■■□□□ 1
Lgals6O54891 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,27■□□□□ 0,99
Lgals6O54891 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Lgals6O54891 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Lgals6O54891 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Lgals6O54891 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,99
Lgals6O54891 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
Lgals6O54891 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Lgals6O54891 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Lgals6O54891 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Lgals6O54891 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Lgals6O54891 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Lgals6O54891 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Lgals6O54891 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,06■□□□□ 0,96
Lgals6O54891 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Lgals6O54891 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Lgals6O54891 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Lgals6O54891 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Lgals6O54891 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Lgals6O54891 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Lgals6O54891 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Lgals6O54891 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Lgals6O54891 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Lgals6O54891 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Lgals6O54891 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Lgals6O54891 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Lgals6O54891 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Lgals6O54891 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Lgals6O54891 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Lgals6O54891 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Lgals6O54891 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Lgals6O54891 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Lgals6O54891 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Lgals6O54891 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,43■□□□□ 0,86
Lgals6O54891 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Lgals6O54891 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Lgals6O54891 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Lgals6O54891 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Lgals6O54891 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Lgals6O54891 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Lgals6O54891 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Lgals6O54891 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Lgals6O54891 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Lgals6O54891 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Lgals6O54891 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,17■□□□□ 0,82
Lgals6O54891 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Lgals6O54891 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Lgals6O54891 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Lgals6O54891 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Lgals6O54891 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Lgals6O54891 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Lgals6O54891 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Lgals6O54891 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,06■□□□□ 0,8
Lgals6O54891 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Lgals6O54891 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Lgals6O54891 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Lgals6O54891 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Lgals6O54891 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Lgals6O54891 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0,79
Lgals6O54891 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Lgals6O54891 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Lgals6O54891 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Lgals6O54891 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19,91■□□□□ 0,78
Lgals6O54891 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Lgals6O54891 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Lgals6O54891 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Lgals6O54891 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Lgals6O54891 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Lgals6O54891 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Lgals6O54891 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Lgals6O54891 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Lgals6O54891 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Lgals6O54891 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,6 ms