Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Defa35E9QLQ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa35E9QLQ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa35E9QLQ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Defa35E9QLQ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa35E9QLQ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Defa35E9QLQ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa35E9QLQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Defa35E9QLQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Defa35E9QLQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defa35E9QLQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Defa35E9QLQ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Defa35E9QLQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa35E9QLQ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Defa35E9QLQ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Defa35E9QLQ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa35E9QLQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa35E9QLQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Defa35E9QLQ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa35E9QLQ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa35E9QLQ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defa35E9QLQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa35E9QLQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa35E9QLQ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa35E9QLQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Defa35E9QLQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Defa35E9QLQ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa35E9QLQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa35E9QLQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa35E9QLQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa35E9QLQ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa35E9QLQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa35E9QLQ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa35E9QLQ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa35E9QLQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa35E9QLQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa35E9QLQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa35E9QLQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa35E9QLQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa35E9QLQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa35E9QLQ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa35E9QLQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa35E9QLQ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa35E9QLQ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa35E9QLQ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa35E9QLQ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Defa35E9QLQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Defa35E9QLQ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Defa35E9QLQ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Defa35E9QLQ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Defa35E9QLQ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Defa35E9QLQ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Defa35E9QLQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Defa35E9QLQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Defa35E9QLQ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa35E9QLQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa35E9QLQ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa35E9QLQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Defa35E9QLQ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Defa35E9QLQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Defa35E9QLQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Defa35E9QLQ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Defa35E9QLQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Defa35E9QLQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Defa35E9QLQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Defa35E9QLQ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Defa35E9QLQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Defa35E9QLQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Defa35E9QLQ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Defa35E9QLQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Defa35E9QLQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Defa35E9QLQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa35E9QLQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa35E9QLQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa35E9QLQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa35E9QLQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa35E9QLQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa35E9QLQ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Defa35E9QLQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa35E9QLQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa35E9QLQ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa35E9QLQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa35E9QLQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa35E9QLQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa35E9QLQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa35E9QLQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa35E9QLQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa35E9QLQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa35E9QLQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa35E9QLQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa35E9QLQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa35E9QLQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa35E9QLQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa35E9QLQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa35E9QLQ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa35E9QLQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa35E9QLQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa35E9QLQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa35E9QLQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Defa35E9QLQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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