RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Leap2Q91V13 76 aa8.55□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf740Q6NZQ6 180 aa8.54□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cphx2Q8BX39 182 aa8.54□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv4-68A0A0B4J1I7 117 aa8.54□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trbv13-1A0A0B4J1P8 112 aa8.54□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Umad1E0CX23 159 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7138L7N2C3 230 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01736 120 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcl1b4P56844 120 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atg101Q9D8Z6 218 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3238W4VSP7 230 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7257D3YX25 99 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm17430F6RSK3 157 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Egr2P08152 470 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem136Q3TYE7 245 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sdhaf1Q3U276 118 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cysltr1Q99JA4 352 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufs7Q9DC70 224 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm14137Q8CE97 175 aa8.53□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A1Y7VMQ4 148 aa8.52□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufa4Q62425 82 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 B230217C12RikE9Q3Z1 139 aa8.52□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-66A0A075B5X5 117 aa8.52□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Esp3J3QN49 87 aa8.52□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gata3P23772 443 aa8.52□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf114Q9ET26 229 aa8.52□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nat8f4G5E8L3 226 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 P84751 237 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 IqcjQ8BPW0 110 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm16223Q8CBM3 117 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fndc10A2A9Q0 223 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxi3E0CZH3 425 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pglyrp1O88593 182 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lamtor2Q9JHS3 125 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm15294V9GXA7 121 aa8.51□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7137J3QMW1 236 aa8.5□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav14-2A0A075B694 121 aa8.5□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fxyd5P97808 178 aa8.5□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q3UNZ8 350 aa8.5□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp5lQ9CPQ8 103 aa8.5□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 SpxD3Z752 116 aa8.49□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ramp1Q9WTJ5 148 aa8.49□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2al1nQ497L1 109 aa8.49□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dkk2Q9QYZ8 259 aa8.49□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm28305F6U473 122 aa8.48□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lgals6O54891 301 aa8.48□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pla2g2eQ9QUL3 142 aa8.48□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gng4P50153 75 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam241bQ9D882 120 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ceacam15A0A0B4J1L0 234 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rab24P35290 203 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Morn3Q8C5T4 241 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 CcsQ9WU84 274 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ormdl2Q9CQZ0 153 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam213bQ9DB60 201 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phlda3Q9WV95 125 aa8.47□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a2Q99ML6 265 aa8.46□□□□□ -1.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10509O88255 85 aa8.46□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav7-2Q5R1I3 112 aa8.46□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav6-6A0A075B603 114 aa8.46□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krtap27-1E9PX37 202 aa8.46□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 OtorQ9JIE3 128 aa8.46□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snx22Q8C084 192 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pam16Q9CQV1 125 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 TtrP07309 147 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cox17P56394 63 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcp4l1Q6W8Q3 68 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem101Q91VP7 257 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav9d-3A0A075B695 113 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm28044L7N1X0 119 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igll1P20764 209 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 A530064D06RikQ8BNV8 229 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snai3Q9QY31 287 aa8.45□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 NpyP57774 97 aa8.44□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scgb1b10A0A087WPW0 93 aa8.44□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa8.44□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa8.44□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9513B3GLJ6 99 aa8.44□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dad1P61804 113 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spry2Q9QXV8 315 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gng7Q61016 68 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chchd7Q8K2Q5 85 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 OdaphJ3QNT8 126 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 TcraP01849 138 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Card19Q9D1I2 183 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lyzl4Q9D925 145 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa8.43□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav12-3A0A075B648 115 aa8.42□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa8.42□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01745 121 aa8.42□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa8.42□□□□□ -1.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 97.5 ms