Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,9■■□□□ 1,26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,18■■□□□ 1,14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,7■■□□□ 1,06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,58■■□□□ 1,05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,95■□□□□ 0,94
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,69■□□□□ 0,9
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,61■□□□□ 0,89
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,87
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Trbv13-1A0A0B4J1P8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,39■□□□□ 0,86
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,35■□□□□ 0,85
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,33■□□□□ 0,85
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