Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I2

Card19, Caspase recruitment domain-containing protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card19Q9D1I2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
Card19Q9D1I2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Card19Q9D1I2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Card19Q9D1I2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Card19Q9D1I2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Card19Q9D1I2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Card19Q9D1I2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Card19Q9D1I2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Card19Q9D1I2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Card19Q9D1I2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Card19Q9D1I2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Card19Q9D1I2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,22
Card19Q9D1I2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Card19Q9D1I2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,61■■□□□ 1,21
Card19Q9D1I2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Card19Q9D1I2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Card19Q9D1I2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Card19Q9D1I2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Card19Q9D1I2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Card19Q9D1I2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Card19Q9D1I2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,2■■□□□ 1,14
Card19Q9D1I2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Card19Q9D1I2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,01■■□□□ 1,11
Card19Q9D1I2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Card19Q9D1I2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Card19Q9D1I2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Card19Q9D1I2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Card19Q9D1I2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Card19Q9D1I2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Card19Q9D1I2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Card19Q9D1I2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Card19Q9D1I2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Card19Q9D1I2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
Card19Q9D1I2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Card19Q9D1I2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Card19Q9D1I2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Card19Q9D1I2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Card19Q9D1I2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Card19Q9D1I2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Card19Q9D1I2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Card19Q9D1I2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Card19Q9D1I2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Card19Q9D1I2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Card19Q9D1I2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Card19Q9D1I2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Card19Q9D1I2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Card19Q9D1I2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
Card19Q9D1I2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Card19Q9D1I2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Card19Q9D1I2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Card19Q9D1I2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Card19Q9D1I2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Card19Q9D1I2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Card19Q9D1I2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Card19Q9D1I2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Card19Q9D1I2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Card19Q9D1I2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Card19Q9D1I2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,89■□□□□ 0,94
Card19Q9D1I2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Card19Q9D1I2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Card19Q9D1I2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Card19Q9D1I2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Card19Q9D1I2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Card19Q9D1I2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Card19Q9D1I2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Card19Q9D1I2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Card19Q9D1I2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Card19Q9D1I2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Card19Q9D1I2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Card19Q9D1I2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Card19Q9D1I2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Card19Q9D1I2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Card19Q9D1I2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Card19Q9D1I2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Card19Q9D1I2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Card19Q9D1I2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Card19Q9D1I2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Card19Q9D1I2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Card19Q9D1I2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Card19Q9D1I2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Card19Q9D1I2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Card19Q9D1I2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Card19Q9D1I2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Card19Q9D1I2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Card19Q9D1I2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Card19Q9D1I2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Card19Q9D1I2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Card19Q9D1I2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Card19Q9D1I2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Card19Q9D1I2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Card19Q9D1I2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Card19Q9D1I2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Card19Q9D1I2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Card19Q9D1I2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Card19Q9D1I2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Card19Q9D1I2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Card19Q9D1I2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Card19Q9D1I2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,23■□□□□ 0,83
Card19Q9D1I2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Card19Q9D1I2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms