Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Z6

Atg101, Autophagy-related protein 101, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg101Q9D8Z6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Atg101Q9D8Z6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Atg101Q9D8Z6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Atg101Q9D8Z6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Atg101Q9D8Z6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Atg101Q9D8Z6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Atg101Q9D8Z6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
Atg101Q9D8Z6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Atg101Q9D8Z6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Atg101Q9D8Z6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Atg101Q9D8Z6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Atg101Q9D8Z6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Atg101Q9D8Z6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Atg101Q9D8Z6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Atg101Q9D8Z6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Atg101Q9D8Z6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Atg101Q9D8Z6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Atg101Q9D8Z6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Atg101Q9D8Z6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Atg101Q9D8Z6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Atg101Q9D8Z6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Atg101Q9D8Z6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Atg101Q9D8Z6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Atg101Q9D8Z6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Atg101Q9D8Z6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Atg101Q9D8Z6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,33■■□□□ 1,17
Atg101Q9D8Z6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Atg101Q9D8Z6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Atg101Q9D8Z6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Atg101Q9D8Z6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Atg101Q9D8Z6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Atg101Q9D8Z6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Atg101Q9D8Z6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Atg101Q9D8Z6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Atg101Q9D8Z6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Atg101Q9D8Z6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
Atg101Q9D8Z6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Atg101Q9D8Z6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Atg101Q9D8Z6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Atg101Q9D8Z6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Atg101Q9D8Z6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Atg101Q9D8Z6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Atg101Q9D8Z6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
Atg101Q9D8Z6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Atg101Q9D8Z6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Atg101Q9D8Z6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Atg101Q9D8Z6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Atg101Q9D8Z6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Atg101Q9D8Z6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Atg101Q9D8Z6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Atg101Q9D8Z6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Atg101Q9D8Z6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Atg101Q9D8Z6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Atg101Q9D8Z6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Atg101Q9D8Z6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Atg101Q9D8Z6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Atg101Q9D8Z6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Atg101Q9D8Z6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Atg101Q9D8Z6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Atg101Q9D8Z6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Atg101Q9D8Z6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Atg101Q9D8Z6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Atg101Q9D8Z6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Atg101Q9D8Z6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Atg101Q9D8Z6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Atg101Q9D8Z6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Atg101Q9D8Z6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Atg101Q9D8Z6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Atg101Q9D8Z6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,14■□□□□ 0,97
Atg101Q9D8Z6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Atg101Q9D8Z6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Atg101Q9D8Z6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,06■□□□□ 0,96
Atg101Q9D8Z6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Atg101Q9D8Z6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Atg101Q9D8Z6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Atg101Q9D8Z6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Atg101Q9D8Z6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Atg101Q9D8Z6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Atg101Q9D8Z6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Atg101Q9D8Z6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Atg101Q9D8Z6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Atg101Q9D8Z6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Atg101Q9D8Z6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Atg101Q9D8Z6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Atg101Q9D8Z6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Atg101Q9D8Z6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Atg101Q9D8Z6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Atg101Q9D8Z6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Atg101Q9D8Z6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Atg101Q9D8Z6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Atg101Q9D8Z6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Atg101Q9D8Z6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Atg101Q9D8Z6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Atg101Q9D8Z6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,91
Atg101Q9D8Z6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Atg101Q9D8Z6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Atg101Q9D8Z6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Atg101Q9D8Z6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,91
Atg101Q9D8Z6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Atg101Q9D8Z6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms