RNA–Protein interactions for RNA: YPL066W

RGL1, Transcript of Regulator of Rho1p signaling, cofactor of Tus1p, yeast

Gene RGL1, Length 1,440 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGL1	YPL066W	STL1	P39932	569 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RGL1	YPL066W	YAT2	P40017	923 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RGL1	YPL066W	IDS2	P46958	469 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RGL1	YPL066W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
RGL1	YPL066W	COS12	P53053	380 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RGL1	YPL066W	SRL1	Q08673	210 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RGL1	YPL066W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.47	□□□□□ -1.85	RIP-Chip
RGL1	YPL066W	URA3	P03962	267 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	EAF5	P39995	279 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YOR389W	Q08912	624 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	GAL4	P04386	881 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	PLM2	Q04383	521 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	PEX15	Q08215	383 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	GSM1	P42950	618 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YNR071C	P53757	342 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	UBP16	Q02863	499 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	LCB4	Q12246	624 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	AMD2	P22580	549 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	MAK32	P23060	363 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	STB5	P38699	743 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	UBP12	P39538	1254 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YIR016W	P40572	265 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	MAD2	P40958	196 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	CIN1	P40987	1014 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YML119W	Q03208	357 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	PSF3	Q12146	194 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	KAR1	P11927	433 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	MDV1	P47025	714 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	DOS2	P54858	310 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	VTC3	Q02725	835 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	RTC1	Q08281	1341 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	CTT1	P06115	562 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YCR043C	P25361	127 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YCR061W	P25639	631 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	TAF5	P38129	798 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YBR071W	P38243	211 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YEN1	P40028	759 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	VFA1	P40080	203 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YML053C	Q04978	212 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	TRI1	Q05024	226 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YDL242W	Q07746	117 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	DIN7	Q12086	430 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	SCO2	P38072	301 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	YIL152W	P40455	235 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	RAD34	Q06665	692 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	PFA4	Q12006	378 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	ATX2	Q12067	313 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RGL1	YPL066W	SWC3	P31376	625 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	VPS8	P39702	1274 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	BOP3	P53958	396 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	TRS31	Q03337	283 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YPL191C	Q08930	360 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	UBX3	Q12229	455 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	ORC5	P50874	479 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YAT1	P80235	687 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	CRF1	Q04930	467 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	SLX4	Q12098	748 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	TMA17	Q12513	150 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	PHO3	P24031	467 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	SIP1	P32578	815 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	SDS22	P36047	338 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	PHM6	Q05637	104 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	NRT1	Q08485	598 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YOR111W	Q99210	232 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	TGL1	P34163	548 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YLF2	P38746	405 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	SAW1	P39735	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	VPS64	Q03944	604 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	DSE3	Q08729	430 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87

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