RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	TMN2	Q04562	672 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	CRF1	Q04930	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	TRM8	Q12009	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	CDC43	P18898	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YPT53	P36019	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	MNT3	P40549	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	MEP3	P53390	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	TFC6	Q06339	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	COX17	Q12287	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	KIN3	P22209	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	CDC5	P32562	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	CNS1	P33313	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	ERP2	P39704	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YER010C	P40011	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	TMA108	P40462	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	ZAP1	P47043	880 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	COG4	Q06096	861 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	DMC1	P25453	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	RPN12	P32496	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	AXL2	P38928	823 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	CBK1	P53894	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	TAF3	Q12297	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	AAC1	P04710	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YPT10	P38146	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	RIC1	P40395	1056 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	SDS3	P40505	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	CRT10	Q08226	957 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	WHI2	P12611	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	PDE1	P22434	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YMC2	P38087	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	LAS21	P40367	830 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	COG1	P53079	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	COQ6	P53318	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	RRI2	Q12348	645 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	URK1	P27515	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	MAM1	P40065	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	PCD1	Q12524	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	YLR302C	O13544	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	SPO16	P17122	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	MRPL9	P31334	269 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	CBF2	P32504	956 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	MTG2	P38860	518 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	STU2	P46675	888 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TAM41	P53230	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	GND2	P53319	492 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	CPR8	P53728	308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	SNO4	Q04902	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	ATG23	Q06671	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	HSP32	Q08992	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	NBP2	Q12163	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	ENT1	Q12518	454 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	SIP1	P32578	815 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	MTH1	P35198	433 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	MIT1	P40002	666 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	ASE1	P50275	885 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HMS1	YOR032C	YML122C	Q03207	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.3 ms