RNA–Protein interactions for RNA: YMR007W

YMR007W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR007W, Length 381 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR007WYMR007W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YPR114WQ06107 315 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SEY1Q99287 776 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W GFA1P14742 717 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W BRF1P29056 596 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W PMT1P33775 817 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W YEL028WP39989 153 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W DLD2P46681 530 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W GLG2P47011 380 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W ASN2P49090 572 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W CDC55Q00362 526 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W UME1Q03010 460 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W BNA5Q05979 453 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W TRE2Q08693 809 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W AFI1Q99222 893 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SEC23P15303 768 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W ATE1P16639 503 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W TGL4P36165 910 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W TAE1P38340 232 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W ERP2P39704 215 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W OPY2Q06810 360 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W THI73Q07904 523 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RTT10Q08924 1013 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W GNT1Q12096 491 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W GPM3Q12326 303 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SBP1P10080 294 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W PDR1P12383 1068 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W TEC1P18412 486 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W MSR1P38714 643 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SPC105P53148 917 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W YML096WQ04489 525 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W TPO1Q07824 586 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W YOR238WQ08634 303 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W TFB4Q12004 338 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SRO7Q12038 1033 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W YEL077CQ3E7X8 1277 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W LEU1P07264 779 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W YKR104WP0CE69 306 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SCH9P11792 824 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W PMA2P19657 947 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W NCL1P38205 684 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W PAN6P40459 309 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W DJP1P40564 432 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SIP4P46954 829 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W NRM1P53718 249 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W VPS9P54787 451 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W IVY1Q04934 453 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SWC7Q06707 132 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W ATG10Q07879 167 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W PGC1Q08959 321 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RKM5Q12367 367 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RDS2P19541 446 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W BIT2P38346 545 aa8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W LRP1P38801 184 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W KHA1P40309 873 aa8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W TRF5P48561 642 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W NBP35P52920 328 aa8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W JJJ1P53863 590 aa8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W IPI3P53877 555 aa8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W IZH4Q99393 312 aa8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W HFA1P32874 2273 aa8.29□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SNT1P25357 1226 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W CIN8P27895 1000 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W MCM2P29469 868 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W DBF4P32325 704 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W AIM18P38884 321 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W ELO1P39540 310 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W SPC72P39723 622 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W RRT5P43607 289 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W YMR018WQ04364 514 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR007WYMR007W GAL4P04386 881 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W CLC1P17891 233 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W MRS6P32864 603 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W MKT1P40850 830 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W CIS3P47001 227 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W RFX1P48743 811 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W YGR021WP53212 290 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W YGR127WP53275 312 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W YNL143CP53908 130 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data8.27□□□□□ -1.09not detected
YMR007WYMR007W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W AAD15Q08361 143 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR007WYMR007W YOR338WQ99326 363 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.3 ms