RNA–Protein interactions for RNA: YLR169W

YLR169W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLR169W, Length 354 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR169W	YLR169W	TDA9	Q04545	1251 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	TRI1	Q05024	226 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	SLX4	Q12098	748 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	LCB4	Q12246	624 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	HER1	Q12276	1246 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	AIM44	Q99299	758 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	CTT1	P06115	562 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	MAK32	P23060	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	VFA1	P40080	203 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	PHM6	Q05637	104 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	MGM1	P32266	881 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	TFC4	P33339	1025 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	TAF5	P38129	798 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	CIN1	P40987	1014 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	YML053C	Q04978	212 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR169W	YLR169W	RTC1	Q08281	1341 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	YCR061W	P25639	631 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	TGL1	P34163	548 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	FLO5	P38894	1075 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	VPS8	P39702	1274 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	PEX14	P53112	341 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	TRS31	Q03337	283 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	PHO3	P24031	467 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	MEP2	P41948	499 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	CRF1	Q04930	467 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	NUR1	Q12066	484 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	SDS22	P36047	338 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	PXL1	P36166	706 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	SAW1	P39735	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	POL31	P46957	487 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	RAD34	Q06665	692 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	PAF1	P38351	445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	ACS1	Q01574	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	YNL034W	P53963	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	YAT1	P80235	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	CRD1	Q07560	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR169W	YLR169W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	SWC3	P31376	625 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	YLF2	P38746	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	VPS64	Q03944	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	MRC1	P25588	1096 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	SIP1	P32578	815 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	SCO2	P38072	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	YIR016W	P40572	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	MDV1	P47025	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	ATX2	Q12067	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	GAL4	P04386	881 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	ADH4	P10127	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	NUP53	Q03790	475 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	AAD4	Q07747	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	PFA4	Q12006	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	PDE1	P22434	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	SWD1	P39706	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	ERV46	P39727	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	IMA5	P40884	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	ASK10	P48361	1146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	ORC5	P50874	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	FOL1	P53848	824 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	VTC3	Q02725	835 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	SNA4	Q07549	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR169W	YLR169W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
YLR169W	YLR169W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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