RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	MNT2	P53059	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YNR071C	P53757	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	GIM3	P53900	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RAD30	Q04049	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RCN2	Q12044	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	BUG1	Q12191	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	COX17	Q12287	69 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	GAL7	P08431	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PRB1	P09232	635 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	CLB3	P24870	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YKR018C	P36114	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	NUP85	P46673	744 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YJR124C	P47159	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ROY1	Q04847	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MSC3	Q05812	728 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	DGR2	P32330	852 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	BCK2	P33306	851 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	GPT2	P36148	743 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MRPL36	P36531	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	COS111	P38308	924 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RFC3	P38629	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	BEM4	P39011	633 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YKE2	P52553	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	IMA1	P53051	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	DSL1	P53847	754 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	HAP5	Q02516	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ECM7	Q06200	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	AFI1	Q99222	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ARG80	P07249	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	CLC1	P17891	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MSN4	P33749	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	SPT23	P35210	1082 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	LRO1	P40345	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PXA1	P41909	870 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YGL242C	P53066	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	VID30	P53076	958 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	CRR1	Q05790	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	TCO89	Q08921	799 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	LDB19	Q12502	818 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	UNG1	P12887	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	AFT1	P22149	690 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ACP1	P32463	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	SLA2	P33338	968 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MSG5	P38590	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YIL077C	P40508	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YIR014W	P40570	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	BST1	P43571	1029 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MAK10	Q02197	733 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YDR344C	Q05510	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PEX19	Q07418	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	TAF3	Q12297	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	APC2	Q12440	853 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	DIF1	O13577	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	VPS3	P23643	1011 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PRO1	P32264	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PHO11	P35842	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ECM4	P36156	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PHO12	P38693	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YHL017W	P38745	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	GPB2	P39717	880 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	CHS6	P40955	746 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MMM1	P41800	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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