RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	IFA38	P38286	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	COS111	P38308	924 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	BCD1	P38772	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
NUS1	YDL193W	YJL193W	P39542	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	NUP60	P39705	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	YEL068C	P39977	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	GET2	P40056	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	VTC2	P43585	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	BSC5	P53755	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	ACS1	Q01574	713 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	FCP1	Q03254	732 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	DLT1	Q04216	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	YFT2	Q06676	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
NUS1	YDL193W	STE11	P23561	717 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	BLI1	P35727	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	FKH2	P41813	862 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	YDL183C	P48569	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	AIM6	Q07716	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	TAH18	Q12181	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	SKM1	Q12469	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	PET122	P10355	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	AAC3	P18238	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	VPS34	P22543	875 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	PRE8	P23639	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	PGS1	P25578	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	REV7	P38927	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	TSC11	P40061	1430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	VTH1	P40438	1549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	BNR1	P40450	1375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	YIL077C	P40508	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	VTH2	P40890	1549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	SKP2	P42843	763 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	MTL1	P53214	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	MAK10	Q02197	733 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	SNO4	Q04902	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	HSP32	Q08992	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUS1	YDL193W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YLR302C	O13544	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	BCS1	P32839	456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TFC3	P34111	1160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YKL050C	P35736	922 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	LYS9	P38999	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	LRO1	P40345	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
NUS1	YDL193W	IRC6	P43615	237 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	IDS2	P46958	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ERG5	P54781	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	RCO1	Q04779	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	NUS1	Q12063	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SFI1	Q12369	946 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TUP1	P16649	713 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SPO16	P17122	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	DSS4	P32601	143 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	NPL6	P32832	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	SET3	P36124	751 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	FMO1	P38866	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
NUS1	YDL193W	ELO3	P40319	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	YJR061W	P40355	935 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MRPS35	P53292	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MRPL19	P53875	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	HUA2	Q12134	243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	COX17	Q12287	69 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ABF1	P14164	731 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	CTS1	P29029	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	PEX5	P35056	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	UBS1	P38290	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	ASE1	P50275	885 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	MUP1	P50276	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUS1	YDL193W	VPS4	P52917	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.8 ms