RNA–Protein interactions for RNA: YCL063W

VAC17, Transcript of Phosphoprotein involved in vacuole inheritance, yeast

Gene VAC17, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAC17	YCL063W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	PHO81	P17442	1178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	IMP2'	P32351	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	ANP1	P32629	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	NUP120	P35729	1037 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	YKL050C	P35736	922 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	MRPL7	P36519	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	ACA1	P39970	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	PMT6	P42934	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	RCF1	Q03713	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	OPY2	Q06810	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	SPT7	P35177	1332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	ADH4	P10127	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	ERG11	P10614	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	MSH1	P25846	959 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	BRF1	P29056	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	DSS4	P32601	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	SAS3	P34218	831 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	PIH1	P38768	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	SWD1	P39706	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	QRI7	P43122	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	GPI8	P49018	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	SNF12	P53628	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	GTR1	Q00582	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	PSR1	Q07800	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	BET2	P20133	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	BEM3	P32873	1128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	PXA2	P34230	853 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	LOT5	P34234	306 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	RKM3	P38222	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	VPS8	P39702	1274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	MEP1	P40260	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	ERR3	P42222	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	GSM1	P42950	618 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	YGR016W	P53209	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	MEP3	P53390	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	CRD1	Q07560	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	TGS1	Q12052	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	CTT1	P06115	562 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	MUP3	P38734	546 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	CAJ1	P39101	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	VFA1	P40080	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	YIP4	P53093	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	TRS23	Q03784	219 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	RGT2	Q12300	763 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAC17	YCL063W	MSS18	P08593	268 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	STE4	P18851	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	CNE1	P27825	502 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	CCL1	P37366	393 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	XBP1	P40489	647 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	IMA5	P40884	581 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	MAD3	P47074	515 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	SGM1	P47166	707 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	BTN2	P53286	410 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	TLG1	Q03322	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	HIM1	Q06674	414 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	AAD4	Q07747	329 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	CIR2	Q08822	631 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	NUP1	P20676	1076 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	RER1	P25560	188 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	APM3	P38153	483 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	RXT2	P38255	430 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	IDS2	P46958	469 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	MRK1	P50873	501 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	BUD17	P53727	317 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	SDH5	Q08230	162 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	SSM4	P40318	1319 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	MRP7	P12687	371 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	STE12	P13574	688 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	SAN1	P22470	610 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	PTP1	P25044	335 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	YMC2	P38087	329 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	MIT1	P40002	666 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	NET1	P47035	1189 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	ACS1	Q01574	713 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	TRS31	Q03337	283 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	VPS64	Q03944	604 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAC17	YCL063W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69

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