RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA EXO1P39875 702 aa3.45□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA COG2P53271 262 aa3.45□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA IRC3Q06683 689 aa3.45□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA AIM6Q07716 390 aa3.45□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA AHA1Q12449 350 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA PIF1P07271 859 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA GSY2P27472 705 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA APM3P38153 483 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA VPS27P40343 622 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YJL043WP47053 257 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA RGT2Q12300 763 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YER175W-AQ8TGU4 54 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA AQY1P0CD91 305 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA MSH1P25846 959 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA GDA1P32621 518 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA ARB1P40024 610 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YNL058CP53947 316 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA ARA2Q04212 335 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA CRF1Q04930 467 aa3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA SEC3P33332 1336 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA MIS1P09440 975 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA PHO81P17442 1178 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA AMD2P22580 549 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA MCM3P24279 971 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YHL041WP38730 149 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA MTG2P38860 518 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA CAB2P40506 365 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA CIR1P42940 261 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YJR008WP47085 338 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA CPR6P53691 371 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA ESF2P53743 316 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA RAD33Q04231 177 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA ORM2Q06144 216 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA LCB4Q12246 624 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YBR255C-AQ3E776 120 aa3.43□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA POL3P15436 1097 aa3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA PDE1P22434 369 aa3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA ARO9P38840 513 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA UBX4P54730 416 aa3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA MOT3P54785 490 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA UBP16Q02863 499 aa3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YML119WQ03208 357 aa3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA HIM1Q06674 414 aa3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YDL242WQ07746 117 aa3.42□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA BIK1P11709 440 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA RIT1P23796 513 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA SWC3P31376 625 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA TPM2P40414 161 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA IMA1P53051 589 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA AAT1Q01802 451 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA ATG21Q02887 496 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA HRD3Q05787 833 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA BSP1Q06604 576 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA CYK3Q07533 885 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA BI2P03873 423 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YUR1P26725 428 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA VPS8P39702 1274 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA SPC72P39723 622 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA SAE2P46946 345 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA BPL1P48445 690 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA ATP23P53722 227 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA PLM2Q04383 521 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA CIR2Q08822 631 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA YPL191CQ08930 360 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA ICL2Q12031 575 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA FRE7Q12333 620 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA Q0010Q9ZZX9 128 aa3.41□□□□□ -1.86
15S_rRNA15S_rRNA ADE3P07245 946 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA PGI1P12709 554 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA RRP43P25359 394 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA KES1P35844 434 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA ACA1P39970 489 aa3.4□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA BST1P43571 1029 aa3.4□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA SIP1P32578 815 aa3.39□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA FSH1P38777 243 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA SAP1P39955 897 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA YML053CQ04978 212 aa3.39□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA GEP3Q08622 556 aa3.39□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA CET1O13297 549 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA PET122P10355 254 aa3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA MSM1P22438 575 aa3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA SWI4P25302 1093 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA BEM3P32873 1128 aa3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA VBA2P38358 474 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA SNO3P43544 222 aa3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA NMD5P46970 1048 aa3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA MPS1P54199 764 aa3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA STP1Q00947 519 aa3.38□□□□□ -1.87
15S_rRNA15S_rRNA YLR111WQ12528 110 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.1 ms