RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000170957.2

Ggps1-201, Transcript of Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ggps1, Length 4,244 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Hist1h2bbQ64475 126 aa7.27□□□□□ -1.25
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Hist1h2bpQ8CGP2 126 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ggps1-201ENSMUST00000170957 NpbQ8K4P1 119 aa7.27□□□□□ -1.25
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm45753A0A1C7CYU8 86 aa7.26□□□□□ -1.25
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa7.26□□□□□ -1.25
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 H2-DMb1P35737 261 aa7.24□□□□□ -1.25
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Mrpl32Q9DCI9 187 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa7.2□□□□□ -1.26
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Spink1P09036 80 aa7.2□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 PmvkQ9D1G2 192 aa7.2□□□□□ -1.26
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Foxi3E0CZH3 425 aa7.2□□□□□ -1.26
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Chd6A3KFM7 2711 aa7.2□□□□□ -1.26
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