Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Shisa9Q9CZN4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shisa9Q9CZN4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shisa9Q9CZN4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shisa9Q9CZN4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Shisa9Q9CZN4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shisa9Q9CZN4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shisa9Q9CZN4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Shisa9Q9CZN4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Shisa9Q9CZN4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shisa9Q9CZN4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shisa9Q9CZN4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shisa9Q9CZN4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shisa9Q9CZN4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Shisa9Q9CZN4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Shisa9Q9CZN4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shisa9Q9CZN4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Shisa9Q9CZN4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shisa9Q9CZN4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shisa9Q9CZN4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shisa9Q9CZN4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shisa9Q9CZN4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shisa9Q9CZN4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shisa9Q9CZN4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shisa9Q9CZN4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shisa9Q9CZN4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shisa9Q9CZN4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Shisa9Q9CZN4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shisa9Q9CZN4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Shisa9Q9CZN4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shisa9Q9CZN4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shisa9Q9CZN4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shisa9Q9CZN4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shisa9Q9CZN4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shisa9Q9CZN4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shisa9Q9CZN4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shisa9Q9CZN4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shisa9Q9CZN4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shisa9Q9CZN4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shisa9Q9CZN4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shisa9Q9CZN4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Shisa9Q9CZN4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shisa9Q9CZN4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shisa9Q9CZN4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shisa9Q9CZN4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shisa9Q9CZN4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shisa9Q9CZN4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shisa9Q9CZN4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shisa9Q9CZN4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shisa9Q9CZN4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shisa9Q9CZN4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shisa9Q9CZN4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Shisa9Q9CZN4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shisa9Q9CZN4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shisa9Q9CZN4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shisa9Q9CZN4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Shisa9Q9CZN4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shisa9Q9CZN4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shisa9Q9CZN4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shisa9Q9CZN4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shisa9Q9CZN4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shisa9Q9CZN4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shisa9Q9CZN4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shisa9Q9CZN4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shisa9Q9CZN4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shisa9Q9CZN4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shisa9Q9CZN4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shisa9Q9CZN4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shisa9Q9CZN4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shisa9Q9CZN4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shisa9Q9CZN4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shisa9Q9CZN4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shisa9Q9CZN4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shisa9Q9CZN4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shisa9Q9CZN4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shisa9Q9CZN4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Shisa9Q9CZN4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Shisa9Q9CZN4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shisa9Q9CZN4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shisa9Q9CZN4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shisa9Q9CZN4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shisa9Q9CZN4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shisa9Q9CZN4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shisa9Q9CZN4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Shisa9Q9CZN4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shisa9Q9CZN4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shisa9Q9CZN4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shisa9Q9CZN4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shisa9Q9CZN4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shisa9Q9CZN4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shisa9Q9CZN4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shisa9Q9CZN4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shisa9Q9CZN4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shisa9Q9CZN4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shisa9Q9CZN4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shisa9Q9CZN4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisa9Q9CZN4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shisa9Q9CZN4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms