Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CtsgP28293 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsgP28293 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtsgP28293 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CtsgP28293 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsgP28293 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsgP28293 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtsgP28293 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsgP28293 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsgP28293 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtsgP28293 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsgP28293 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsgP28293 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsgP28293 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsgP28293 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsgP28293 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsgP28293 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsgP28293 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsgP28293 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsgP28293 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsgP28293 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsgP28293 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsgP28293 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsgP28293 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsgP28293 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsgP28293 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsgP28293 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsgP28293 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsgP28293 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsgP28293 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsgP28293 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsgP28293 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsgP28293 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsgP28293 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsgP28293 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsgP28293 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsgP28293 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsgP28293 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsgP28293 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsgP28293 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsgP28293 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CtsgP28293 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsgP28293 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsgP28293 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsgP28293 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsgP28293 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsgP28293 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsgP28293 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsgP28293 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsgP28293 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsgP28293 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsgP28293 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsgP28293 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsgP28293 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsgP28293 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsgP28293 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsgP28293 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsgP28293 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsgP28293 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsgP28293 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsgP28293 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsgP28293 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsgP28293 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsgP28293 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsgP28293 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtsgP28293 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsgP28293 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsgP28293 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsgP28293 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsgP28293 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsgP28293 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsgP28293 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsgP28293 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsgP28293 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtsgP28293 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsgP28293 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsgP28293 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsgP28293 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsgP28293 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsgP28293 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsgP28293 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsgP28293 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsgP28293 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsgP28293 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtsgP28293 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtsgP28293 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtsgP28293 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsgP28293 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CtsgP28293 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtsgP28293 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsgP28293 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsgP28293 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsgP28293 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsgP28293 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtsgP28293 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtsgP28293 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtsgP28293 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtsgP28293 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtsgP28293 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtsgP28293 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms