Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl13aP19253 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl13aP19253 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13aP19253 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl13aP19253 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl13aP19253 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl13aP19253 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl13aP19253 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13aP19253 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl13aP19253 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl13aP19253 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl13aP19253 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl13aP19253 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13aP19253 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl13aP19253 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl13aP19253 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl13aP19253 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl13aP19253 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl13aP19253 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl13aP19253 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl13aP19253 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl13aP19253 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl13aP19253 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl13aP19253 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl13aP19253 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl13aP19253 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl13aP19253 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl13aP19253 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl13aP19253 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl13aP19253 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl13aP19253 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl13aP19253 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl13aP19253 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl13aP19253 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl13aP19253 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpl13aP19253 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl13aP19253 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl13aP19253 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl13aP19253 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpl13aP19253 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl13aP19253 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl13aP19253 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl13aP19253 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl13aP19253 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl13aP19253 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl13aP19253 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl13aP19253 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl13aP19253 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13aP19253 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl13aP19253 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl13aP19253 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl13aP19253 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl13aP19253 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl13aP19253 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl13aP19253 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl13aP19253 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl13aP19253 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13aP19253 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl13aP19253 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl13aP19253 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl13aP19253 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl13aP19253 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl13aP19253 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl13aP19253 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl13aP19253 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl13aP19253 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl13aP19253 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl13aP19253 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl13aP19253 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl13aP19253 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl13aP19253 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl13aP19253 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl13aP19253 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl13aP19253 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl13aP19253 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl13aP19253 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl13aP19253 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl13aP19253 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl13aP19253 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl13aP19253 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl13aP19253 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl13aP19253 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl13aP19253 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl13aP19253 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpl13aP19253 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl13aP19253 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl13aP19253 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl13aP19253 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpl13aP19253 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl13aP19253 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl13aP19253 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl13aP19253 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl13aP19253 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpl13aP19253 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpl13aP19253 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpl13aP19253 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpl13aP19253 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpl13aP19253 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpl13aP19253 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpl13aP19253 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 450.4 ms