Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W3

Ighv1-53, Immunoglobulin heavy variable 1-53 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ighv1-53A0A075B5W3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ighv1-53A0A075B5W3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ighv1-53A0A075B5W3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ighv1-53A0A075B5W3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ighv1-53A0A075B5W3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ighv1-53A0A075B5W3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ighv1-53A0A075B5W3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighv1-53A0A075B5W3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighv1-53A0A075B5W3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ighv1-53A0A075B5W3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv1-53A0A075B5W3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ighv1-53A0A075B5W3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ighv1-53A0A075B5W3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ighv1-53A0A075B5W3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighv1-53A0A075B5W3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighv1-53A0A075B5W3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighv1-53A0A075B5W3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighv1-53A0A075B5W3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv1-53A0A075B5W3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv1-53A0A075B5W3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv1-53A0A075B5W3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighv1-53A0A075B5W3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighv1-53A0A075B5W3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighv1-53A0A075B5W3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv1-53A0A075B5W3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighv1-53A0A075B5W3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv1-53A0A075B5W3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv1-53A0A075B5W3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-53A0A075B5W3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighv1-53A0A075B5W3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-53A0A075B5W3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighv1-53A0A075B5W3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv1-53A0A075B5W3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv1-53A0A075B5W3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv1-53A0A075B5W3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv1-53A0A075B5W3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighv1-53A0A075B5W3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv1-53A0A075B5W3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv1-53A0A075B5W3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighv1-53A0A075B5W3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv1-53A0A075B5W3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighv1-53A0A075B5W3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighv1-53A0A075B5W3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv1-53A0A075B5W3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-53A0A075B5W3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ighv1-53A0A075B5W3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-53A0A075B5W3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-53A0A075B5W3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ighv1-53A0A075B5W3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ighv1-53A0A075B5W3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ighv1-53A0A075B5W3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-53A0A075B5W3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv1-53A0A075B5W3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv1-53A0A075B5W3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-53A0A075B5W3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-53A0A075B5W3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-53A0A075B5W3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-53A0A075B5W3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-53A0A075B5W3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv1-53A0A075B5W3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-53A0A075B5W3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-53A0A075B5W3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-53A0A075B5W3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ighv1-53A0A075B5W3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ighv1-53A0A075B5W3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ighv1-53A0A075B5W3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ighv1-53A0A075B5W3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ighv1-53A0A075B5W3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ighv1-53A0A075B5W3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ighv1-53A0A075B5W3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv1-53A0A075B5W3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ighv1-53A0A075B5W3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ighv1-53A0A075B5W3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ighv1-53A0A075B5W3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ighv1-53A0A075B5W3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ighv1-53A0A075B5W3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ighv1-53A0A075B5W3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ighv1-53A0A075B5W3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ighv1-53A0A075B5W3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ighv1-53A0A075B5W3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ighv1-53A0A075B5W3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms