RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm45785A0A1B0GT05 94 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 H2al2bA9Z055 111 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm2381G3UY53 305 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01726 129 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prss2P07146 246 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P18525 117 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mfge8P21956 463 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm11232Q5SPI8 295 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znrd1Q791N7 123 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 BsxQ810B3 232 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arl3Q9WUL7 182 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tcf24V9GWT9 166 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PtprbB2RU80 1998 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm28539A0A087WSL9 92 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igkv14-111A0A140T8P9 117 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Edn3P48299 214 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpl32P62911 135 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem52Q9D702 196 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr954Q9EQB6 314 aa7.29□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ApcsP12246 224 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SlpiP97430 131 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1209Q3SXJ3 310 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mbnl3Q8R003 342 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrpl51Q9CPY1 128 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav6n-6A0A075B6B2 114 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ins2P01326 110 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eda2rQ8BX35 297 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr470Q8VF65 314 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem147Q9CQG6 224 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Iglc1A0A0G2JE99 106 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1024A2ASU7 327 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ca1P13634 261 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr996Q7TRA0 314 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rhbdd2Q8VEK2 361 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rasl11bQ922H7 247 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DscamQ9ERC8 2013 aa7.28□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr143P34985 313 aa7.27□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fgf12P61329 243 aa7.27□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm10192Q3V0S1 108 aa7.27□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r195Q5SVD6 316 aa7.27□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Crip3Q6Q6R3 243 aa7.27□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1243Q8VGM7 305 aa7.27□□□□□ -1.24
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav6-6A0A075B603 114 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav16nA0A075B634 117 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav8-1A0A075B641 109 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PkigO70139 76 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cd200r3Q5UKY4 296 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 9930022D16RikQ8BG27 128 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Muc15Q8C6Z1 331 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cml3Q9JIY8 226 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav7-4A0A075B6C1 113 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm15056F6ZR08 88 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ascl2O35885 263 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hoxb4P10284 250 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Oosp2Q4FZG8 168 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav7d-4Q5R1H9 113 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdkn2aQ64364 169 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HeylQ9DBX7 326 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rspo1Q9Z132 265 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lnp1A0A1B0GSK3 178 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01728 117 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P18526 117 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ifna12Q80SS5 189 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ndfip1Q8R0W6 221 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nat6Q9R123 314 aa7.27□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm12253Q5NC48 229 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav15-1-dv6-1Q5R1D2 117 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc9cQ810A3 171 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc25a48Q8BW66 306 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Celsr3Q91ZI0 3301 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav4-2A0A075B638 110 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r1E9PVR6 306 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01724 129 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NpsP0C0P8 89 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PigyP0C1P0 71 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lgals1P16045 135 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr368Q8VF22 327 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chd6A3KFM7 2711 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TracA0A075B662 137 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trbv13-3A0A0B4J1H2 113 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp456B2RUK9 458 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1419Q7TQS2 343 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnase2aQ8K196 155 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrpl16Q99N93 251 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Try5Q9QUK9 246 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Try4Q9R0T7 246 aa7.26□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav12-1A0N8R1 115 aa7.25□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 3110021N24RikJ3QMN2 152 aa7.25□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpl27aP14115 148 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spem1Q5F289 310 aa7.25□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1373Q7TQT6 311 aa7.25□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 A730015C16RikQ8C992 119 aa7.25□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wbp2nlQ9D529 359 aa7.25□□□□□ -1.25
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm27027S4R1M6 97 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.3 ms