Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSL9

Gm28539, Predicted gene 28539, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28539A0A087WSL9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Gm28539A0A087WSL9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Gm28539A0A087WSL9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Gm28539A0A087WSL9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Gm28539A0A087WSL9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Gm28539A0A087WSL9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Gm28539A0A087WSL9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,29■□□□□ 0,84
Gm28539A0A087WSL9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Gm28539A0A087WSL9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Gm28539A0A087WSL9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Gm28539A0A087WSL9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Gm28539A0A087WSL9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19,9■□□□□ 0,78
Gm28539A0A087WSL9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Gm28539A0A087WSL9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Gm28539A0A087WSL9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Gm28539A0A087WSL9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,55■□□□□ 0,72
Gm28539A0A087WSL9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,71
Gm28539A0A087WSL9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Gm28539A0A087WSL9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Gm28539A0A087WSL9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Gm28539A0A087WSL9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,39■□□□□ 0,69
Gm28539A0A087WSL9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,35■□□□□ 0,69
Gm28539A0A087WSL9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19,21■□□□□ 0,67
Gm28539A0A087WSL9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Gm28539A0A087WSL9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Gm28539A0A087WSL9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Gm28539A0A087WSL9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Gm28539A0A087WSL9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Gm28539A0A087WSL9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18,91■□□□□ 0,62
Gm28539A0A087WSL9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18,88■□□□□ 0,61
Gm28539A0A087WSL9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Gm28539A0A087WSL9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Gm28539A0A087WSL9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Gm28539A0A087WSL9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Gm28539A0A087WSL9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18,74■□□□□ 0,59
Gm28539A0A087WSL9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18,73■□□□□ 0,59
Gm28539A0A087WSL9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Gm28539A0A087WSL9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Gm28539A0A087WSL9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC18,64■□□□□ 0,57
Gm28539A0A087WSL9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18,61■□□□□ 0,57
Gm28539A0A087WSL9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Gm28539A0A087WSL9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,57■□□□□ 0,56
Gm28539A0A087WSL9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm28539A0A087WSL9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
Gm28539A0A087WSL9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
Gm28539A0A087WSL9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
Gm28539A0A087WSL9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Gm28539A0A087WSL9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,3■□□□□ 0,52
Gm28539A0A087WSL9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Gm28539A0A087WSL9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Gm28539A0A087WSL9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,24■□□□□ 0,51
Gm28539A0A087WSL9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Gm28539A0A087WSL9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Gm28539A0A087WSL9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Gm28539A0A087WSL9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Gm28539A0A087WSL9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Gm28539A0A087WSL9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Gm28539A0A087WSL9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Gm28539A0A087WSL9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Gm28539A0A087WSL9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Gm28539A0A087WSL9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm28539A0A087WSL9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm28539A0A087WSL9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm28539A0A087WSL9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Gm28539A0A087WSL9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Gm28539A0A087WSL9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Gm28539A0A087WSL9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Gm28539A0A087WSL9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Gm28539A0A087WSL9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Gm28539A0A087WSL9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Gm28539A0A087WSL9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Gm28539A0A087WSL9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Gm28539A0A087WSL9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Gm28539A0A087WSL9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Gm28539A0A087WSL9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Gm28539A0A087WSL9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Gm28539A0A087WSL9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Gm28539A0A087WSL9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Gm28539A0A087WSL9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Gm28539A0A087WSL9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Gm28539A0A087WSL9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,78■□□□□ 0,44
Gm28539A0A087WSL9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Gm28539A0A087WSL9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Gm28539A0A087WSL9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Gm28539A0A087WSL9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Gm28539A0A087WSL9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,68■□□□□ 0,42
Gm28539A0A087WSL9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Gm28539A0A087WSL9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Gm28539A0A087WSL9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Gm28539A0A087WSL9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Gm28539A0A087WSL9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17,64■□□□□ 0,41
Gm28539A0A087WSL9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Gm28539A0A087WSL9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Gm28539A0A087WSL9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Gm28539A0A087WSL9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Gm28539A0A087WSL9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
Gm28539A0A087WSL9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Gm28539A0A087WSL9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,55■□□□□ 0,4
Gm28539A0A087WSL9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Gm28539A0A087WSL9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,39
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