Protein–RNA interactions for Protein: P16045

Lgals1, Galectin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals1P16045 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgals1P16045 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lgals1P16045 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lgals1P16045 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgals1P16045 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lgals1P16045 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lgals1P16045 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgals1P16045 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgals1P16045 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgals1P16045 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgals1P16045 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgals1P16045 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgals1P16045 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lgals1P16045 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgals1P16045 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lgals1P16045 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgals1P16045 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgals1P16045 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lgals1P16045 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgals1P16045 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgals1P16045 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgals1P16045 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgals1P16045 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgals1P16045 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgals1P16045 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgals1P16045 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgals1P16045 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgals1P16045 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgals1P16045 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgals1P16045 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgals1P16045 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgals1P16045 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgals1P16045 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgals1P16045 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgals1P16045 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgals1P16045 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgals1P16045 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgals1P16045 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgals1P16045 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgals1P16045 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgals1P16045 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgals1P16045 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgals1P16045 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgals1P16045 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgals1P16045 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgals1P16045 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgals1P16045 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgals1P16045 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgals1P16045 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgals1P16045 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgals1P16045 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgals1P16045 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgals1P16045 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgals1P16045 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lgals1P16045 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lgals1P16045 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgals1P16045 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgals1P16045 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgals1P16045 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgals1P16045 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgals1P16045 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lgals1P16045 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lgals1P16045 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lgals1P16045 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgals1P16045 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgals1P16045 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgals1P16045 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgals1P16045 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgals1P16045 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgals1P16045 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgals1P16045 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgals1P16045 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgals1P16045 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgals1P16045 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgals1P16045 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgals1P16045 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgals1P16045 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgals1P16045 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgals1P16045 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgals1P16045 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgals1P16045 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgals1P16045 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lgals1P16045 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lgals1P16045 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgals1P16045 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgals1P16045 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgals1P16045 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgals1P16045 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgals1P16045 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgals1P16045 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgals1P16045 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lgals1P16045 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lgals1P16045 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgals1P16045 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgals1P16045 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgals1P16045 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgals1P16045 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lgals1P16045 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgals1P16045 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgals1P16045 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms