Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Ifna12Q80SS5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ifna12Q80SS5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ifna12Q80SS5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ifna12Q80SS5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Ifna12Q80SS5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ifna12Q80SS5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ifna12Q80SS5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ifna12Q80SS5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Ifna12Q80SS5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ifna12Q80SS5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ifna12Q80SS5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ifna12Q80SS5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Ifna12Q80SS5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Ifna12Q80SS5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ifna12Q80SS5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ifna12Q80SS5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ifna12Q80SS5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ifna12Q80SS5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Ifna12Q80SS5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ifna12Q80SS5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Ifna12Q80SS5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ifna12Q80SS5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ifna12Q80SS5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Ifna12Q80SS5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ifna12Q80SS5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ifna12Q80SS5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ifna12Q80SS5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Ifna12Q80SS5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ifna12Q80SS5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ifna12Q80SS5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Ifna12Q80SS5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ifna12Q80SS5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ifna12Q80SS5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ifna12Q80SS5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ifna12Q80SS5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ifna12Q80SS5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,87■■□□□ 1,41
Ifna12Q80SS5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ifna12Q80SS5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Ifna12Q80SS5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ifna12Q80SS5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Ifna12Q80SS5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ifna12Q80SS5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ifna12Q80SS5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ifna12Q80SS5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ifna12Q80SS5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ifna12Q80SS5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ifna12Q80SS5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ifna12Q80SS5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ifna12Q80SS5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,39■■□□□ 1,33
Ifna12Q80SS5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Ifna12Q80SS5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ifna12Q80SS5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Ifna12Q80SS5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ifna12Q80SS5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Ifna12Q80SS5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ifna12Q80SS5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ifna12Q80SS5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ifna12Q80SS5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,95■■□□□ 1,26
Ifna12Q80SS5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ifna12Q80SS5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ifna12Q80SS5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ifna12Q80SS5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ifna12Q80SS5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ifna12Q80SS5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ifna12Q80SS5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ifna12Q80SS5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ifna12Q80SS5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ifna12Q80SS5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ifna12Q80SS5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ifna12Q80SS5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ifna12Q80SS5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ifna12Q80SS5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ifna12Q80SS5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ifna12Q80SS5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ifna12Q80SS5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ifna12Q80SS5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Ifna12Q80SS5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ifna12Q80SS5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ifna12Q80SS5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Ifna12Q80SS5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Ifna12Q80SS5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ifna12Q80SS5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,48■■□□□ 1,19
Ifna12Q80SS5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ifna12Q80SS5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ifna12Q80SS5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ifna12Q80SS5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ifna12Q80SS5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ifna12Q80SS5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ifna12Q80SS5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Ifna12Q80SS5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ifna12Q80SS5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ifna12Q80SS5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ifna12Q80SS5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ifna12Q80SS5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ifna12Q80SS5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ifna12Q80SS5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Ifna12Q80SS5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Ifna12Q80SS5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Ifna12Q80SS5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,8 ms