Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Rhbdd2Q8VEK2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rhbdd2Q8VEK2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rhbdd2Q8VEK2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rhbdd2Q8VEK2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rhbdd2Q8VEK2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rhbdd2Q8VEK2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rhbdd2Q8VEK2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rhbdd2Q8VEK2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdd2Q8VEK2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rhbdd2Q8VEK2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rhbdd2Q8VEK2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rhbdd2Q8VEK2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rhbdd2Q8VEK2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rhbdd2Q8VEK2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rhbdd2Q8VEK2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdd2Q8VEK2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rhbdd2Q8VEK2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdd2Q8VEK2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhbdd2Q8VEK2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhbdd2Q8VEK2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rhbdd2Q8VEK2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdd2Q8VEK2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhbdd2Q8VEK2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdd2Q8VEK2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhbdd2Q8VEK2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhbdd2Q8VEK2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rhbdd2Q8VEK2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdd2Q8VEK2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdd2Q8VEK2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhbdd2Q8VEK2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdd2Q8VEK2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhbdd2Q8VEK2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdd2Q8VEK2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhbdd2Q8VEK2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdd2Q8VEK2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhbdd2Q8VEK2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhbdd2Q8VEK2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhbdd2Q8VEK2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhbdd2Q8VEK2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhbdd2Q8VEK2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhbdd2Q8VEK2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rhbdd2Q8VEK2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rhbdd2Q8VEK2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhbdd2Q8VEK2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhbdd2Q8VEK2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdd2Q8VEK2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdd2Q8VEK2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdd2Q8VEK2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhbdd2Q8VEK2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhbdd2Q8VEK2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhbdd2Q8VEK2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhbdd2Q8VEK2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhbdd2Q8VEK2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhbdd2Q8VEK2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdd2Q8VEK2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdd2Q8VEK2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdd2Q8VEK2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdd2Q8VEK2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdd2Q8VEK2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdd2Q8VEK2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdd2Q8VEK2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdd2Q8VEK2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdd2Q8VEK2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdd2Q8VEK2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdd2Q8VEK2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdd2Q8VEK2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdd2Q8VEK2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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