Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL7

Arl3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl3Q9WUL7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Arl3Q9WUL7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Arl3Q9WUL7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Arl3Q9WUL7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Arl3Q9WUL7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Arl3Q9WUL7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Arl3Q9WUL7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Arl3Q9WUL7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
Arl3Q9WUL7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Arl3Q9WUL7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
Arl3Q9WUL7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Arl3Q9WUL7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,3■■□□□ 1,48
Arl3Q9WUL7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
Arl3Q9WUL7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Arl3Q9WUL7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Arl3Q9WUL7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Arl3Q9WUL7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Arl3Q9WUL7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Arl3Q9WUL7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Arl3Q9WUL7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Arl3Q9WUL7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Arl3Q9WUL7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Arl3Q9WUL7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Arl3Q9WUL7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Arl3Q9WUL7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Arl3Q9WUL7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Arl3Q9WUL7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Arl3Q9WUL7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Arl3Q9WUL7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,44■■□□□ 1,34
Arl3Q9WUL7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Arl3Q9WUL7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,34
Arl3Q9WUL7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Arl3Q9WUL7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Arl3Q9WUL7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Arl3Q9WUL7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Arl3Q9WUL7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Arl3Q9WUL7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Arl3Q9WUL7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Arl3Q9WUL7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Arl3Q9WUL7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Arl3Q9WUL7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Arl3Q9WUL7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Arl3Q9WUL7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Arl3Q9WUL7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Arl3Q9WUL7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Arl3Q9WUL7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Arl3Q9WUL7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Arl3Q9WUL7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Arl3Q9WUL7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Arl3Q9WUL7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,5■■□□□ 1,19
Arl3Q9WUL7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Arl3Q9WUL7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Arl3Q9WUL7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Arl3Q9WUL7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Arl3Q9WUL7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Arl3Q9WUL7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Arl3Q9WUL7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Arl3Q9WUL7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Arl3Q9WUL7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Arl3Q9WUL7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Arl3Q9WUL7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Arl3Q9WUL7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,3■■□□□ 1,16
Arl3Q9WUL7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Arl3Q9WUL7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Arl3Q9WUL7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Arl3Q9WUL7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Arl3Q9WUL7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,14■■□□□ 1,13
Arl3Q9WUL7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Arl3Q9WUL7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Arl3Q9WUL7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,08■■□□□ 1,13
Arl3Q9WUL7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Arl3Q9WUL7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Arl3Q9WUL7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Arl3Q9WUL7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Arl3Q9WUL7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Arl3Q9WUL7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Arl3Q9WUL7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
Arl3Q9WUL7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Arl3Q9WUL7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Arl3Q9WUL7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Arl3Q9WUL7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Arl3Q9WUL7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Arl3Q9WUL7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Arl3Q9WUL7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Arl3Q9WUL7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,77■■□□□ 1,07
Arl3Q9WUL7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Arl3Q9WUL7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Arl3Q9WUL7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Arl3Q9WUL7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Arl3Q9WUL7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Arl3Q9WUL7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,06
Arl3Q9WUL7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Arl3Q9WUL7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Arl3Q9WUL7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Arl3Q9WUL7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Arl3Q9WUL7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Arl3Q9WUL7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Arl3Q9WUL7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Arl3Q9WUL7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,54■■□□□ 1,04
Arl3Q9WUL7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,7 ms