Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
P18525 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
P18525 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
P18525 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
P18525 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
P18525 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
P18525 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
P18525 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P18525 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
P18525 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P18525 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
P18525 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P18525 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
P18525 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
P18525 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P18525 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
P18525 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
P18525 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P18525 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P18525 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P18525 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
P18525 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
P18525 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P18525 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
P18525 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
P18525 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P18525 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
P18525 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
P18525 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P18525 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P18525 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P18525 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P18525 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P18525 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
P18525 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P18525 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P18525 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P18525 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P18525 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P18525 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
P18525 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P18525 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
P18525 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P18525 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P18525 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P18525 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P18525 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P18525 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P18525 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
P18525 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P18525 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P18525 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P18525 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P18525 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P18525 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P18525 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P18525 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
P18525 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P18525 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P18525 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P18525 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P18525 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P18525 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P18525 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P18525 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P18525 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P18525 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P18525 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P18525 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P18525 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P18525 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P18525 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P18525 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P18525 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
P18525 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
P18525 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P18525 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P18525 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P18525 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P18525 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P18525 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P18525 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P18525 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P18525 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P18525 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P18525 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P18525 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P18525 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P18525 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P18525 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P18525 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P18525 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P18525 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P18525 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P18525 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P18525 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P18525 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P18525 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P18525 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P18525 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
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