Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
P18526 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
P18526 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
P18526 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
P18526 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P18526 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
P18526 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
P18526 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
P18526 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
P18526 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P18526 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P18526 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P18526 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
P18526 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
P18526 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
P18526 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P18526 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
P18526 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
P18526 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P18526 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P18526 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P18526 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
P18526 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P18526 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P18526 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P18526 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
P18526 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
P18526 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P18526 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
P18526 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
P18526 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P18526 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P18526 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
P18526 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
P18526 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
P18526 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
P18526 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
P18526 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P18526 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P18526 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
P18526 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
P18526 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P18526 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P18526 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P18526 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P18526 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P18526 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
P18526 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
P18526 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P18526 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P18526 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P18526 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
P18526 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
P18526 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
P18526 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
P18526 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
P18526 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P18526 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P18526 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P18526 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P18526 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
P18526 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
P18526 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
P18526 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P18526 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
P18526 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P18526 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
P18526 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P18526 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P18526 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P18526 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P18526 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P18526 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P18526 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P18526 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P18526 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P18526 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P18526 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P18526 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P18526 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
P18526 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P18526 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P18526 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P18526 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
P18526 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
P18526 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P18526 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P18526 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P18526 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P18526 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P18526 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P18526 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P18526 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P18526 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P18526 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P18526 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P18526 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P18526 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
P18526 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P18526 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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