Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Edn3P48299 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Edn3P48299 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Edn3P48299 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Edn3P48299 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Edn3P48299 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Edn3P48299 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Edn3P48299 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Edn3P48299 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Edn3P48299 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Edn3P48299 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Edn3P48299 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Edn3P48299 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Edn3P48299 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edn3P48299 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edn3P48299 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edn3P48299 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Edn3P48299 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Edn3P48299 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Edn3P48299 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Edn3P48299 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edn3P48299 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edn3P48299 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edn3P48299 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Edn3P48299 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edn3P48299 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edn3P48299 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Edn3P48299 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edn3P48299 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edn3P48299 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Edn3P48299 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Edn3P48299 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Edn3P48299 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Edn3P48299 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Edn3P48299 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edn3P48299 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Edn3P48299 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edn3P48299 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Edn3P48299 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Edn3P48299 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Edn3P48299 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Edn3P48299 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Edn3P48299 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Edn3P48299 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Edn3P48299 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edn3P48299 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edn3P48299 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Edn3P48299 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Edn3P48299 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Edn3P48299 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Edn3P48299 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Edn3P48299 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Edn3P48299 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Edn3P48299 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Edn3P48299 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edn3P48299 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edn3P48299 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edn3P48299 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edn3P48299 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edn3P48299 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Edn3P48299 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Edn3P48299 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Edn3P48299 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Edn3P48299 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Edn3P48299 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edn3P48299 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edn3P48299 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edn3P48299 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edn3P48299 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Edn3P48299 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Edn3P48299 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Edn3P48299 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edn3P48299 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edn3P48299 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edn3P48299 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edn3P48299 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edn3P48299 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edn3P48299 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edn3P48299 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Edn3P48299 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Edn3P48299 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edn3P48299 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edn3P48299 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edn3P48299 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edn3P48299 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edn3P48299 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edn3P48299 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edn3P48299 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edn3P48299 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Edn3P48299 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Edn3P48299 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edn3P48299 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edn3P48299 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edn3P48299 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edn3P48299 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edn3P48299 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edn3P48299 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edn3P48299 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edn3P48299 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edn3P48299 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms