Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
P01728 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
P01728 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P01728 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
P01728 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
P01728 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
P01728 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
P01728 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P01728 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
P01728 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01728 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01728 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01728 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01728 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01728 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01728 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01728 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
P01728 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01728 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01728 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01728 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01728 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01728 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
P01728 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01728 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01728 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01728 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01728 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
P01728 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01728 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01728 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
P01728 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01728 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01728 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01728 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01728 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01728 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01728 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
P01728 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01728 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01728 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
P01728 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01728 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01728 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01728 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01728 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01728 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01728 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01728 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01728 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01728 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01728 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01728 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01728 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01728 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01728 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01728 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01728 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
P01728 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01728 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01728 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01728 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01728 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01728 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
P01728 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01728 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01728 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01728 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01728 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01728 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01728 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01728 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01728 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01728 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01728 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01728 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01728 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01728 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01728 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01728 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P01728 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01728 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01728 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01728 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01728 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01728 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01728 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P01728 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01728 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01728 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01728 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01728 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01728 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01728 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01728 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01728 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01728 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01728 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01728 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01728 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms