Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG27

9930022D16Rik, RIKEN cDNA 9930022D16 gene, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930022D16RikQ8BG27 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
9930022D16RikQ8BG27 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
9930022D16RikQ8BG27 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
9930022D16RikQ8BG27 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
9930022D16RikQ8BG27 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
9930022D16RikQ8BG27 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
9930022D16RikQ8BG27 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
9930022D16RikQ8BG27 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
9930022D16RikQ8BG27 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
9930022D16RikQ8BG27 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
9930022D16RikQ8BG27 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
9930022D16RikQ8BG27 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
9930022D16RikQ8BG27 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
9930022D16RikQ8BG27 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
9930022D16RikQ8BG27 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
9930022D16RikQ8BG27 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
9930022D16RikQ8BG27 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
9930022D16RikQ8BG27 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
9930022D16RikQ8BG27 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
9930022D16RikQ8BG27 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
9930022D16RikQ8BG27 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
9930022D16RikQ8BG27 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
9930022D16RikQ8BG27 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
9930022D16RikQ8BG27 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
9930022D16RikQ8BG27 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
9930022D16RikQ8BG27 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
9930022D16RikQ8BG27 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
9930022D16RikQ8BG27 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
9930022D16RikQ8BG27 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
9930022D16RikQ8BG27 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
9930022D16RikQ8BG27 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
9930022D16RikQ8BG27 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
9930022D16RikQ8BG27 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
9930022D16RikQ8BG27 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
9930022D16RikQ8BG27 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
9930022D16RikQ8BG27 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
9930022D16RikQ8BG27 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
9930022D16RikQ8BG27 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
9930022D16RikQ8BG27 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
9930022D16RikQ8BG27 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
9930022D16RikQ8BG27 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
9930022D16RikQ8BG27 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
9930022D16RikQ8BG27 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
9930022D16RikQ8BG27 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
9930022D16RikQ8BG27 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
9930022D16RikQ8BG27 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
9930022D16RikQ8BG27 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
9930022D16RikQ8BG27 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
9930022D16RikQ8BG27 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
9930022D16RikQ8BG27 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
9930022D16RikQ8BG27 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
9930022D16RikQ8BG27 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
9930022D16RikQ8BG27 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
9930022D16RikQ8BG27 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
9930022D16RikQ8BG27 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
9930022D16RikQ8BG27 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
9930022D16RikQ8BG27 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
9930022D16RikQ8BG27 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
9930022D16RikQ8BG27 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
9930022D16RikQ8BG27 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
9930022D16RikQ8BG27 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
9930022D16RikQ8BG27 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
9930022D16RikQ8BG27 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
9930022D16RikQ8BG27 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
9930022D16RikQ8BG27 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
9930022D16RikQ8BG27 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
9930022D16RikQ8BG27 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
9930022D16RikQ8BG27 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
9930022D16RikQ8BG27 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
9930022D16RikQ8BG27 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
9930022D16RikQ8BG27 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
9930022D16RikQ8BG27 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
9930022D16RikQ8BG27 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
9930022D16RikQ8BG27 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
9930022D16RikQ8BG27 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
9930022D16RikQ8BG27 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
9930022D16RikQ8BG27 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
9930022D16RikQ8BG27 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
9930022D16RikQ8BG27 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
9930022D16RikQ8BG27 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
9930022D16RikQ8BG27 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
9930022D16RikQ8BG27 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
9930022D16RikQ8BG27 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
9930022D16RikQ8BG27 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
9930022D16RikQ8BG27 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
9930022D16RikQ8BG27 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
9930022D16RikQ8BG27 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
9930022D16RikQ8BG27 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
9930022D16RikQ8BG27 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
9930022D16RikQ8BG27 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9930022D16RikQ8BG27 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
9930022D16RikQ8BG27 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
9930022D16RikQ8BG27 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
9930022D16RikQ8BG27 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
9930022D16RikQ8BG27 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
9930022D16RikQ8BG27 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9930022D16RikQ8BG27 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9930022D16RikQ8BG27 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
9930022D16RikQ8BG27 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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