Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,11■■■□□ 2,73
P01724 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
P01724 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
P01724 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
P01724 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,79■■■□□ 2,04
P01724 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
P01724 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
P01724 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
P01724 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
P01724 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
P01724 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
P01724 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
P01724 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
P01724 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
P01724 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
P01724 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,99■■□□□ 1,75
P01724 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
P01724 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
P01724 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
P01724 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
P01724 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
P01724 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,7■■□□□ 1,7
P01724 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
P01724 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
P01724 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
P01724 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
P01724 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
P01724 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,44■■□□□ 1,66
P01724 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
P01724 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
P01724 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
P01724 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
P01724 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
P01724 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
P01724 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
P01724 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
P01724 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,98■■□□□ 1,59
P01724 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
P01724 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,89■■□□□ 1,58
P01724 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
P01724 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,78■■□□□ 1,56
P01724 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
P01724 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,7■■□□□ 1,54
P01724 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,66■■□□□ 1,54
P01724 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
P01724 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
P01724 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
P01724 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
P01724 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
P01724 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
P01724 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
P01724 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
P01724 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
P01724 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
P01724 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
P01724 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
P01724 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
P01724 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
P01724 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
P01724 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
P01724 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
P01724 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
P01724 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
P01724 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
P01724 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
P01724 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
P01724 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
P01724 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,87■■□□□ 1,41
P01724 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,84■■□□□ 1,41
P01724 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,83■■□□□ 1,41
P01724 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
P01724 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
P01724 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
P01724 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
P01724 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
P01724 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
P01724 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
P01724 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,73■■□□□ 1,39
P01724 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
P01724 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
P01724 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
P01724 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
P01724 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
P01724 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
P01724 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
P01724 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
P01724 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,6■■□□□ 1,37
P01724 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
P01724 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
P01724 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
P01724 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,53■■□□□ 1,36
P01724 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
P01724 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,51■■□□□ 1,35
P01724 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
P01724 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
P01724 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,45■■□□□ 1,35
P01724 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
P01724 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
P01724 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
P01724 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms