Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
P01724 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
P01724 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
P01724 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
P01724 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
P01724 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
P01724 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P01724 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
P01724 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
P01724 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
P01724 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
P01724 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P01724 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
P01724 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
P01724 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P01724 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P01724 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P01724 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
P01724 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
P01724 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01724 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01724 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01724 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P01724 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
P01724 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01724 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P01724 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
P01724 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
P01724 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01724 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01724 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P01724 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
P01724 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
P01724 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P01724 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
P01724 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
P01724 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
P01724 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
P01724 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
P01724 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01724 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01724 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01724 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01724 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01724 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
P01724 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01724 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01724 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01724 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01724 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01724 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01724 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
P01724 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01724 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01724 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
P01724 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01724 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01724 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01724 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01724 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
P01724 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01724 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01724 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01724 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01724 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01724 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01724 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01724 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01724 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01724 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01724 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01724 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01724 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01724 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01724 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01724 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
P01724 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01724 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01724 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01724 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01724 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01724 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
P01724 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01724 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01724 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01724 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01724 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01724 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01724 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01724 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01724 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
P01724 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01724 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01724 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01724 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01724 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
P01724 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01724 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01724 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01724 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms