RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C CUE2P36075 443 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C GRS1P38088 690 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C TSC10P38342 320 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C HXT5P38695 592 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C TRM5P38793 499 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C SEN34P39707 275 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C EMP65P40085 556 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PFK26P40433 827 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PRK1P40494 810 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C MDE1P47095 244 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YJR098CP47139 656 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C RSM26P47141 266 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PEX21P50091 288 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PSP2P50109 593 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C MAL11P53048 616 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C RMR1P53060 241 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C RIM8P53179 542 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C CGR1P53188 120 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C SNF12P53628 566 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C MUK1Q02866 612 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PML39Q03760 334 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C CAB1Q04430 367 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C GAL83Q04739 417 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C NSE3Q05541 303 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PEX10Q05568 337 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C ARV1Q06541 321 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C RAX1Q08760 435 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C AIM41Q12032 185 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C GET3Q12154 354 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C MAM3Q12296 706 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YHR213W-AQ8TGT4 77 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C RAD61Q99359 647 aa3.57□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PBS2P08018 668 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YGL041W-AP0C5N3 154 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C ERG11P10614 530 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C STE12P13574 688 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C RAD4P14736 754 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C ALG1P16661 449 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.56□□□□□ -1.84not detected
SPT4YGR063C HNM1P19807 563 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C APN1P22936 367 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C CLB3P24870 427 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C RVS161P25343 265 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C ITR1P30605 584 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C TFC1P32367 649 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C SRP101P32916 621 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YBR138CP38277 524 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C TDP1P38319 544 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C SWC5P38326 303 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YHL008CP38750 627 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C MAM33P40513 266 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C REF2P42073 533 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YFL066CP43538 392 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C FET5P43561 622 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C SAD1P43589 448 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C LSM1P47017 172 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C BPL1P48445 690 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C RIM21P48565 533 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C GPI8P49018 411 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C NAS6P50086 228 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C MND1P53102 219 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YGR021WP53212 290 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C UTP8P53276 713 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C NAF1P53919 492 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data3.56□□□□□ -1.84 RIP-Chip
SPT4YGR063C UTP6Q02354 440 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C TDA9Q04545 1251 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PHM6Q05637 104 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C ATG38Q05789 226 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C VTA1Q06263 330 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C BCP1Q06338 283 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YAP7Q08182 245 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C SSP2Q08646 371 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C TMA46Q12000 345 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C MED2Q12124 431 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C MCD1Q12158 566 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YDR061WQ12298 539 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C ATG31Q12421 196 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C FMP16Q12497 93 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C YEL077CQ3E7X8 1277 aa3.56□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C CCP1P00431 361 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C ATP2P00830 511 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C URA3P03962 267 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C COR1P07256 457 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C TUB1P09733 447 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C MRPL33P20084 86 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C PTP1P25044 335 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C CYM1P32898 989 aa3.55□□□□□ -1.84
SPT4YGR063C SPC42P36094 363 aa3.55□□□□□ -1.84
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