RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	GRS2	Q06817	618 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.78	□□□□□ -2.28	not detected
CSE1	YGL238W	OCA5	P38738	679 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RAD26	P40352	1085 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	IRC7	P43623	340 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	PEP1	P32319	1579 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HSL1	P34244	1518 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.78	□□□□□ -2.29	not detected
CSE1	YGL238W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GAL11	P19659	1081 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	COQ3	P27680	312 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CCL1	P37366	393 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.78	□□□□□ -2.29	not detected
CSE1	YGL238W	BRN1	P38170	754 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MTG2	P38860	518 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	ECM9	Q02202	377 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YDL073W	Q07454	984 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	HFI1	Q12060	488 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	LCB4	Q12246	624 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GIN4	Q12263	1142 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	AIM44	Q99299	758 aa		0.78	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CDC25	P04821	1589 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SEC15	P22224	910 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GSH1	P32477	678 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	OAF3	P36023	863 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MDV1	P47025	714 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	TAF4	P50105	388 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PEF1	P53238	335 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RNH70	P53331	553 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	BOP3	P53958	396 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YML119W	Q03208	357 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CAC2	Q04199	468 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	VPS33	P20795	691 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CNA1	P23287	553 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GDA1	P32621	518 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	FTH1	P38310	465 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PCL6	P40038	420 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PXA1	P41909	870 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YJL107C	P42947	387 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	WAR1	Q03631	944 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SMA2	Q04658	369 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	TPO3	Q06451	622 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	BSC6	Q08280	497 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	UBX3	Q12229	455 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	FAB1	P34756	2278 aa		0.77	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	KRE9	P39005	276 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GPG1	P53130	126 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	NTG2	Q08214	380 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.76	□□□□□ -2.29	not detected
CSE1	YGL238W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	ATP12	P22135	325 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	HES1	P35843	434 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SDH8	P38345	138 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PPE1	P38796	400 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	IRC5	P43610	853 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RET2	P43621	546 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	COS12	P53053	380 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YCG1	Q06680	1035 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YOR131C	Q12486	218 aa		0.76	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	HMG2	P12684	1045 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	LOT5	P34234	306 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YIR016W	P40572	265 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	AZF1	P41696	914 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	ARP9	Q05123	467 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PFA4	Q12006	378 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RPO31	P04051	1460 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CIT2	P08679	460 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PPZ1	P26570	692 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MAK10	Q02197	733 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MFM1	Q02783	413 aa		0.75	□□□□□ -2.29

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