RNA–Protein interactions for RNA: YBL039C

URA7, Transcript of Major CTP synthase isozyme (see also URA8), yeast

Gene URA7, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA7	YBL039C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	ENT4	Q07872	247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TGL5	Q12043	749 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	NFI1	Q12216	726 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	CBS1	P14066	229 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	RSC6	P25632	483 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	MTC7	P32633	139 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
URA7	YBL039C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	NGL3	Q03210	505 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TLG1	Q03322	224 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	VPS64	Q03944	604 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	RAD30	Q04049	632 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	GPR1	Q12361	961 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	HMG2	P12684	1045 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-C	P25383	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TRK2	P28584	889 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	MGM1	P32266	881 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	UIP5	P36137	443 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	RFC5	P38251	354 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	YHR078W	P38799	552 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	CTF8	P38877	133 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SSU1	P41930	458 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	VPS4	P52917	437 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	YBP2	P53169	641 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	YGR012W	P53206	393 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	HOT1	Q03213	719 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	ADY4	Q05955	493 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	CDA1	Q06702	301 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-B	Q12260	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	REC107	P21651	314 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	CLB1	P24868	471 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	PRE4	P30657	266 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	STB6	P36085	766 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SAK1	P38990	1142 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	VFA1	P40080	203 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	MDE1	P47095	244 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	GYL1	Q04322	720 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	ASM4	Q05166	528 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SGO1	Q08490	590 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	UPC2	Q12151	913 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	FRE6	Q12473	712 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SKS1	Q12505	502 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	APE1	P14904	514 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	CLB3	P24870	427 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SMF1	P38925	575 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	LYS9	P38999	446 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	PZF1	P39933	429 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	PCL7	P40186	285 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	CIT3	P43635	486 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	AAD10	P47182	288 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	EOS1	P53938	366 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	REG1	Q00816	1014 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	VAM6	Q07468	1049 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	ICL2	Q12031	575 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	PET122	P10355	254 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	YPT7	P32939	208 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SWH1	P35845	1188 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SRO77	P38163	1010 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	CDS1	P38221	457 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	PSD1	P39006	500 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	MET18	P40469	1032 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	YIR007W	P40566	764 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	THI6	P41835	540 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	JJJ1	P53863	590 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	REC102	Q02721	264 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	YPL107W	Q02873	248 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TRS31	Q03337	283 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	MSC2	Q03455	724 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	GPB1	Q08886	897 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	NUS1	Q12063	375 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	SUL2	Q12325	893 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.49
URA7	YBL039C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.49

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