RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-1

RDN25-1, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-1, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-1RDN25-1 DIE2P50076 525 aa9.86□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 SNT1P25357 1226 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 RPS5P26783 225 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 YJL107CP42947 387 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 RPN9Q04062 393 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 SGT1Q08446 395 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 GRX6Q12438 231 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 TUB2P02557 457 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 ADP1P25371 1049 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 NIP1P32497 812 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 YHR219WP38900 624 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 ROG3P43602 733 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 USE1P53146 245 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 TMA20P89886 181 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 UFO1Q04511 668 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 RGA2Q06407 1009 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 SYO1Q07395 620 aa9.85□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 PEP5P12868 1029 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 NPP1P25353 742 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 AVT1P47082 602 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 COS5P47187 383 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 STB3Q12427 513 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 SRD1P09007 221 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 HEM15P16622 393 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 BDF1P35817 686 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 YNR063WP53749 607 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 TEP1P53916 434 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 ADY3Q07732 790 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 RPN13O13563 156 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 NMT1P14743 455 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 VPS34P22543 875 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 YBR138CP38277 524 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 VHR2P40041 505 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 RPT2P40327 437 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 MDV1P47025 714 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 BNA3P47039 444 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 YDL109CQ12103 647 aa9.84□□□□□ -0.83
RDN25-1RDN25-1 RPT5P33297 434 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 RFC3P38629 340 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 GEM1P39722 662 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PFK26P40433 827 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 ABZ2Q03266 374 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YCS4Q06156 1176 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DXO1Q06349 442 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 ATP16Q12165 160 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YPT6Q99260 215 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data9.83□□□□□ -0.84not detected
RDN25-1RDN25-1 AEP2P22136 580 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data9.83□□□□□ -0.84not detected
RDN25-1RDN25-1 HBS1P32769 611 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 CST26P38226 397 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YGR111WP53265 400 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 GPI17Q04080 534 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YMR027WQ04371 470 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YDR222WQ04925 415 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 FIG2P25653 1609 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 RAD10P06838 210 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YML6P51998 286 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DBP6P53734 629 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 OSH6Q02201 448 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YDR476CQ03362 224 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 OYE2Q03558 400 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YLR053CQ12026 108 aa9.83□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 HEM3P28789 327 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MEI4P29467 408 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MUD1P32605 298 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 UBP11P36026 717 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PDX3P38075 228 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 VPS70P47161 811 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 STB4P50104 949 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 BIO4P53630 237 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PCL8Q08966 492 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 HSP42Q12329 375 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SNF1P06782 633 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DBP3P20447 523 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MRPL40P36534 297 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DUG2P38149 878 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 BFA1P47113 574 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 HSH155P49955 971 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MED4Q12343 284 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 EMP46Q12396 444 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YDL206WQ12424 762 aa9.82□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 RPL6BP05739 176 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YSC84P32793 468 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MAL11P53048 616 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YGR054WP53235 642 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 WHI4Q07655 649 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 YPL191CQ08930 360 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 MDM20Q12387 796 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 DBP5P20449 482 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 EUG1P32474 517 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 POP4P38336 279 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 SMF2P38778 549 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 EDC3P39998 551 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 FTR1P40088 404 aa9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 PRO2P54885 456 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RDN25-1RDN25-1 ARX1Q03862 593 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms