RNA–Protein interactions for RNA: YDL057W

YDL057W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YDL057W, Length 987 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL057WYDL057W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-DR3Q99231 1755 aa9.48□□□□□ -0.89
YDL057WYDL057W MMS1Q06211 1407 aa9.48□□□□□ -0.89
YDL057WYDL057W IRC20Q06554 1556 aa9.47□□□□□ -0.89
YDL057WYDL057W YRF1-1P0CX20 1796 aa9.46□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W YRF1-5P0CX21 1796 aa9.46□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W YRF1-8P0CX22 1796 aa9.46□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W HOP09932 586 aa9.45□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W DCD1P06773 312 aa9.44□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W MMS22Q06164 1454 aa9.42□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W TRM732Q03496 1420 aa9.41□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W TFC8Q12308 588 aa9.41□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W DRS2P39524 1355 aa9.4□□□□□ -0.9
YDL057WYDL057W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W VPS15P22219 1454 aa9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W DNF2Q12675 1612 aa9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W TY1B-ER2Q03619 1755 aa9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W TY1B-MR1Q04214 1755 aa9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W TY1B-NL1Q12112 1755 aa9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W TY1B-GR1Q12141 1755 aa9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W TY1B-BLQ12490 1755 aa9.35□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W NUP159P40477 1460 aa9.34□□□□□ -0.91
YDL057WYDL057W NTE1Q04958 1679 aa9.32□□□□□ -0.92
YDL057WYDL057W RIM101P33400 625 aa9.29□□□□□ -0.92
YDL057WYDL057W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
YDL057WYDL057W SPP41P38904 1435 aa9.24□□□□□ -0.93
YDL057WYDL057W SMC4Q12267 1418 aa9.24□□□□□ -0.93
YDL057WYDL057W POL1P13382 1468 aa9.23□□□□□ -0.93
YDL057WYDL057W YOR1P53049 1477 aa9.2□□□□□ -0.94
YDL057WYDL057W NUP170P38181 1502 aa9.2□□□□□ -0.94
YDL057WYDL057W SCY1P53009 804 aa9.19□□□□□ -0.94
YDL057WYDL057W VTH1P40438 1549 aa9.19□□□□□ -0.94
YDL057WYDL057W VTH2P40890 1549 aa9.19□□□□□ -0.94
YDL057WYDL057W YOR093CQ12275 1648 aa9.19□□□□□ -0.94
YDL057WYDL057W TSC11P40061 1430 aa9.18□□□□□ -0.94
YDL057WYDL057W SPO14P36126 1683 aa9.16□□□□□ -0.94
YDL057WYDL057W SNT2P53127 1403 aa9.14□□□□□ -0.95
YDL057WYDL057W MYO4P32492 1471 aa9.12□□□□□ -0.95
YDL057WYDL057W STU1P38198 1513 aa9.11□□□□□ -0.95
YDL057WYDL057W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
YDL057WYDL057W BCH2P36122 765 aa9.1□□□□□ -0.95
YDL057WYDL057W DOP1Q03921 1698 aa9.09□□□□□ -0.95
YDL057WYDL057W ULS1Q08562 1619 aa9.09□□□□□ -0.95
YDL057WYDL057W MET10P39692 1035 aa9.06□□□□□ -0.96
YDL057WYDL057W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
YDL057WYDL057W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
YDL057WYDL057W TRM3Q07527 1436 aa9.02□□□□□ -0.97
YDL057WYDL057W PDR12Q02785 1511 aa9□□□□□ -0.97
YDL057WYDL057W OXP1P28273 1286 aa9□□□□□ -0.97
YDL057WYDL057W PDR10P51533 1564 aa8.97□□□□□ -0.97
YDL057WYDL057W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
YDL057WYDL057W BUD3P25558 1636 aa8.95□□□□□ -0.98
YDL057WYDL057W STH1P32597 1359 aa8.95□□□□□ -0.98
YDL057WYDL057W IQG1Q12280 1495 aa8.95□□□□□ -0.98
YDL057WYDL057W TGL3P40308 642 aa8.94□□□□□ -0.98
YDL057WYDL057W MLP2P40457 1679 aa8.94□□□□□ -0.98
YDL057WYDL057W GDB1Q06625 1536 aa8.93□□□□□ -0.98
YDL057WYDL057W RTT106P40161 455 aa8.9□□□□□ -0.98
YDL057WYDL057W DNF3Q12674 1656 aa8.89□□□□□ -0.99
YDL057WYDL057W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
YDL057WYDL057W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
YDL057WYDL057W YTA7P40340 1379 aa8.87□□□□□ -0.99
YDL057WYDL057W EPS1P40557 701 aa8.86□□□□□ -0.99
YDL057WYDL057W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
YDL057WYDL057W PTP3P40048 928 aa8.84□□□□□ -0.99
YDL057WYDL057W BDF1P35817 686 aa8.83□□□□□ -1
YDL057WYDL057W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
YDL057WYDL057W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
YDL057WYDL057W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YDL057WYDL057W YAP3P38749 330 aa8.73□□□□□ -1.01
YDL057WYDL057W USO1P25386 1790 aa8.72□□□□□ -1.01
YDL057WYDL057W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
YDL057WYDL057W TY3B-GQ99315 1547 aa8.7□□□□□ -1.02
YDL057WYDL057W RSM7P47150 247 aa8.7□□□□□ -1.02
YDL057WYDL057W UBP9P39967 754 aa8.69□□□□□ -1.02
YDL057WYDL057W MAK10Q02197 733 aa8.69□□□□□ -1.02
YDL057WYDL057W TFA1P36100 482 aa8.67□□□□□ -1.02
YDL057WYDL057W BNR1P40450 1375 aa8.65□□□□□ -1.02
YDL057WYDL057W AI2P03876 854 aa8.65□□□□□ -1.02
YDL057WYDL057W BBC1P47068 1157 aa8.62□□□□□ -1.03
YDL057WYDL057W SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YDL057WYDL057W URN1Q06525 465 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
YDL057WYDL057W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W CAT8P39113 1433 aa8.57□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W YLR271WQ06152 274 aa8.56□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W MST1P07236 462 aa8.55□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W YBT1P32386 1661 aa8.55□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W YMR196WQ04336 1088 aa8.54□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W TAF7Q05021 590 aa8.54□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W HAP1P0CE41 1502 aa8.54□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W YSP2Q06681 1438 aa8.54□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W YOR238WQ08634 303 aa8.53□□□□□ -1.04
YDL057WYDL057W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.5□□□□□ -1.05
YDL057WYDL057W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.48□□□□□ -1.05not detected
YDL057WYDL057W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.9 ms