RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608306.5

LINC00635-217, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00635, Length 873 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-217ENST00000608306 CHD1O14646 1710 aa15.02□□□□□ -0.01
LINC00635-217ENST00000608306 ARHGEF11O15085 1522 aa15.02□□□□□ -0.01
LINC00635-217ENST00000608306 GRIN2BQ13224 1484 aa15.01□□□□□ -0.01
LINC00635-217ENST00000608306 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.98□□□□□ -0.01
LINC00635-217ENST00000608306 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
LINC00635-217ENST00000608306 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LINC00635-217ENST00000608306 WDR97A6NE52 1622 aa14.96□□□□□ -0.01
LINC00635-217ENST00000608306 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00635-217ENST00000608306 SYNJ2O15056 1496 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00635-217ENST00000608306 SYNJ1O43426 1573 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00635-217ENST00000608306 TOP2BQ02880 1626 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00635-217ENST00000608306 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC00635-217ENST00000608306 ARAP1Q96P48 1450 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00635-217ENST00000608306 PBRM1Q86U86 1689 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC00635-217ENST00000608306 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00635-217ENST00000608306 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00635-217ENST00000608306 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.84□□□□□ -0.03
LINC00635-217ENST00000608306 GRIN2AQ12879 1464 aa14.8□□□□□ -0.04
LINC00635-217ENST00000608306 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.79□□□□□ -0.04
LINC00635-217ENST00000608306 ADAMTS12P58397 1594 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00635-217ENST00000608306 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00635-217ENST00000608306 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00635-217ENST00000608306 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LINC00635-217ENST00000608306 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LINC00635-217ENST00000608306 NUP160Q12769 1436 aa14.73□□□□□ -0.05
LINC00635-217ENST00000608306 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LINC00635-217ENST00000608306 CEP170Q5SW79 1584 aa14.72□□□□□ -0.05
LINC00635-217ENST00000608306 JPH4Q96JJ6 628 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00635-217ENST00000608306 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LINC00635-217ENST00000608306 KIF27Q86VH2 1401 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00635-217ENST00000608306 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00635-217ENST00000608306 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LINC00635-217ENST00000608306 IGF1RP08069 1367 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00635-217ENST00000608306 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LINC00635-217ENST00000608306 ZBTB22O15209 634 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00635-217ENST00000608306 APLP2Q06481 763 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00635-217ENST00000608306 CAPN15O75808 1086 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00635-217ENST00000608306 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00635-217ENST00000608306 SHROOM2Q13796 1616 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00635-217ENST00000608306 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00635-217ENST00000608306 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
LINC00635-217ENST00000608306 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00635-217ENST00000608306 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00635-217ENST00000608306 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00635-217ENST00000608306 CUL7Q14999 1698 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00635-217ENST00000608306 DSG3P32926 999 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LINC00635-217ENST00000608306 PTPRGP23470 1445 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00635-217ENST00000608306 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00635-217ENST00000608306 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.44□□□□□ -0.1
LINC00635-217ENST00000608306 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.44□□□□□ -0.1
LINC00635-217ENST00000608306 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.41□□□□□ -0.1
LINC00635-217ENST00000608306 IQGAP2Q13576 1575 aa14.39□□□□□ -0.11
LINC00635-217ENST00000608306 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.38□□□□□ -0.11
LINC00635-217ENST00000608306 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.35□□□□□ -0.11
LINC00635-217ENST00000608306 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
LINC00635-217ENST00000608306 MAPKBP1O60336 1514 aa14.33□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 DISP1Q96F81 1524 aa14.33□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.32□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.32□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 UACAQ9BZF9 1416 aa14.31□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.3□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 ABCB7O75027 752 aa14.29□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 ABCC2Q92887 1545 aa14.29□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.29□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 DIP2BQ9P265 1576 aa14.28□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 PRXQ9BXM0 1461 aa14.27□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 ASXL2Q76L83 1435 aa14.27□□□□□ -0.12
LINC00635-217ENST00000608306 P3H3Q8IVL6 736 aa14.27□□□□□ -0.13
LINC00635-217ENST00000608306 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
LINC00635-217ENST00000608306 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.25□□□□□ -0.13
LINC00635-217ENST00000608306 KIAA0556O60303 1618 aa14.25□□□□□ -0.13
LINC00635-217ENST00000608306 GOLGA3Q08378 1498 aa14.24□□□□□ -0.13
LINC00635-217ENST00000608306 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.24□□□□□ -0.13
LINC00635-217ENST00000608306 TSPOAP1O95153 1857 aa14.22□□□□□ -0.13
LINC00635-217ENST00000608306 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.21□□□□□ -0.13
LINC00635-217ENST00000608306 ARID3CA6NKF2 412 aa14.21□□□□□ -0.13
LINC00635-217ENST00000608306 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.2□□□□□ -0.14
LINC00635-217ENST00000608306 KCNH8Q96L42 1107 aa14.2□□□□□ -0.14
LINC00635-217ENST00000608306 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.2□□□□□ -0.14
LINC00635-217ENST00000608306 POLA2Q14181 598 aa14.19□□□□□ -0.14
LINC00635-217ENST00000608306 EEA1Q15075 1411 aa14.15□□□□□ -0.14
LINC00635-217ENST00000608306 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
LINC00635-217ENST00000608306 KDM6BO15054 1643 aa14.15□□□□□ -0.14
LINC00635-217ENST00000608306 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
LINC00635-217ENST00000608306 GLI2P10070 1586 aa14.13□□□□□ -0.15
LINC00635-217ENST00000608306 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.12□□□□□ -0.15
LINC00635-217ENST00000608306 ABCA8O94911 1581 aa14.1□□□□□ -0.15
LINC00635-217ENST00000608306 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
LINC00635-217ENST00000608306 CD109Q6YHK3 1445 aa14.07□□□□□ -0.16
LINC00635-217ENST00000608306 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.07□□□□□ -0.16
LINC00635-217ENST00000608306 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
LINC00635-217ENST00000608306 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.05□□□□□ -0.16
LINC00635-217ENST00000608306 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.05□□□□□ -0.16
LINC00635-217ENST00000608306 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.05□□□□□ -0.16
LINC00635-217ENST00000608306 ATP10BO94823 1461 aa14.05□□□□□ -0.16
LINC00635-217ENST00000608306 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
LINC00635-217ENST00000608306 SAMD9Q5K651 1589 aa14.03□□□□□ -0.16
LINC00635-217ENST00000608306 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms