RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522969.1

ARHGEF10-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ARHGEF10, Length 2,349 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ARHGEF10-211ENST00000522969 FBLN2P98095 1184 aa24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF10-211ENST00000522969 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF10-211ENST00000522969 CLIP1P30622 1438 aa24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF10-211ENST00000522969 GRIN2BQ13224 1484 aa24.62■■□□□ 1.53
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ARHGEF10-211ENST00000522969 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.62■■□□□ 1.53
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ARHGEF10-211ENST00000522969 CEP170Q5SW79 1584 aa24.2■■□□□ 1.47
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ARHGEF10-211ENST00000522969 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.14■■□□□ 1.45
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ARHGEF10-211ENST00000522969 JPH4Q96JJ6 628 aa24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF10-211ENST00000522969 ARAP1Q96P48 1450 aa24.09■■□□□ 1.45
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ARHGEF10-211ENST00000522969 BCANQ96GW7 911 aa24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF10-211ENST00000522969 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF10-211ENST00000522969 KCNH8Q96L42 1107 aa24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF10-211ENST00000522969 ARHGEF11O15085 1522 aa24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF10-211ENST00000522969 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF10-211ENST00000522969 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24■■□□□ 1.43
ARHGEF10-211ENST00000522969 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
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ARHGEF10-211ENST00000522969 CCER2I3L3R5 266 aa23.97■■□□□ 1.43
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ARHGEF10-211ENST00000522969 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.96■■□□□ 1.43
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ARHGEF10-211ENST00000522969 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.91■■□□□ 1.42
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ARHGEF10-211ENST00000522969 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.83■■□□□ 1.41
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ARHGEF10-211ENST00000522969 MAP3K1Q13233 1512 aa23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF10-211ENST00000522969 DISP1Q96F81 1524 aa23.81■■□□□ 1.4
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ARHGEF10-211ENST00000522969 KIAA0556O60303 1618 aa23.66■■□□□ 1.38
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ARHGEF10-211ENST00000522969 UACAQ9BZF9 1416 aa23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF10-211ENST00000522969 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF10-211ENST00000522969 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF10-211ENST00000522969 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF10-211ENST00000522969 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF10-211ENST00000522969 TONSLQ96HA7 1378 aa23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF10-211ENST00000522969 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF10-211ENST00000522969 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF10-211ENST00000522969 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF10-211ENST00000522969 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
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