RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522969.1

ARHGEF10-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ARHGEF10, Length 2,349 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10-211ENST00000522969 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.82■■■■□ 3.16
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ARHGEF10-211ENST00000522969 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.31■■■□□ 2.28
ARHGEF10-211ENST00000522969 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF10-211ENST00000522969 NACADO15069 1562 aa28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF10-211ENST00000522969 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF10-211ENST00000522969 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF10-211ENST00000522969 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF10-211ENST00000522969 HRCP23327 699 aa28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10-211ENST00000522969 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
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ARHGEF10-211ENST00000522969 SCRIBQ14160 1630 aa28.2■■■□□ 2.1
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ARHGEF10-211ENST00000522969 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF10-211ENST00000522969 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF10-211ENST00000522969 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF10-211ENST00000522969 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF10-211ENST00000522969 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.57■■■□□ 2
ARHGEF10-211ENST00000522969 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
ARHGEF10-211ENST00000522969 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
ARHGEF10-211ENST00000522969 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.26■■□□□ 1.95
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ARHGEF10-211ENST00000522969 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
ARHGEF10-211ENST00000522969 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF10-211ENST00000522969 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF10-211ENST00000522969 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.97■■□□□ 1.91
ARHGEF10-211ENST00000522969 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF10-211ENST00000522969 SMARCA4P51532 1647 aa26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF10-211ENST00000522969 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF10-211ENST00000522969 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF10-211ENST00000522969 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF10-211ENST00000522969 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ARHGEF10-211ENST00000522969 NCAPD3P42695 1498 aa26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF10-211ENST00000522969 SMARCA2P51531 1590 aa26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF10-211ENST00000522969 WIZO95785 1651 aa26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF10-211ENST00000522969 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF10-211ENST00000522969 MYT1Q01538 1121 aa26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF10-211ENST00000522969 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF10-211ENST00000522969 HMGXB3Q12766 1538 aa26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10-211ENST00000522969 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF10-211ENST00000522969 TRIM41Q8WV44 630 aa26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF10-211ENST00000522969 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF10-211ENST00000522969 NESP48681 1621 aa26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF10-211ENST00000522969 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
ARHGEF10-211ENST00000522969 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.08■■□□□ 1.76
ARHGEF10-211ENST00000522969 NEUROD1Q13562 356 aa26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF10-211ENST00000522969 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF10-211ENST00000522969 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF10-211ENST00000522969 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF10-211ENST00000522969 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
ARHGEF10-211ENST00000522969 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF10-211ENST00000522969 CFTRP13569 1480 aa25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF10-211ENST00000522969 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF10-211ENST00000522969 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF10-211ENST00000522969 ERCC6Q03468 1493 aa25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF10-211ENST00000522969 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF10-211ENST00000522969 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10-211ENST00000522969 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF10-211ENST00000522969 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.6■■□□□ 1.69
ARHGEF10-211ENST00000522969 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF10-211ENST00000522969 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF10-211ENST00000522969 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF10-211ENST00000522969 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF10-211ENST00000522969 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF10-211ENST00000522969 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF10-211ENST00000522969 PRDM2Q13029 1718 aa25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF10-211ENST00000522969 WDR62O43379 1518 aa25.33■■□□□ 1.64
ARHGEF10-211ENST00000522969 CUX2O14529 1486 aa25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF10-211ENST00000522969 TOPBP1Q92547 1522 aa25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF10-211ENST00000522969 CEP162Q5TB80 1403 aa25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF10-211ENST00000522969 ABCC8Q09428 1581 aa25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF10-211ENST00000522969 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF10-211ENST00000522969 CUX1P39880 1505 aa25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF10-211ENST00000522969 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF10-211ENST00000522969 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF10-211ENST00000522969 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF10-211ENST00000522969 MIER1Q8N108 512 aa25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF10-211ENST00000522969 EEA1Q15075 1411 aa25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF10-211ENST00000522969 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF10-211ENST00000522969 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF10-211ENST00000522969 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF10-211ENST00000522969 SYNJ1O43426 1573 aa25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF10-211ENST00000522969 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF10-211ENST00000522969 SOGA1O94964 1423 aa25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF10-211ENST00000522969 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF10-211ENST00000522969 IFT140Q96RY7 1462 aa24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF10-211ENST00000522969 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF10-211ENST00000522969 TOP2BQ02880 1626 aa24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF10-211ENST00000522969 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.583e-6■■■■□ 21.5
ARHGEF10-211ENST00000522969 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF10-211ENST00000522969 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF10-211ENST00000522969 GOLGA3Q08378 1498 aa24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF10-211ENST00000522969 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF10-211ENST00000522969 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF10-211ENST00000522969 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF10-211ENST00000522969 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF10-211ENST00000522969 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF10-211ENST00000522969 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF10-211ENST00000522969 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.71■■□□□ 1.55
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