RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476867.6

PRRX1-203, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRX1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-203ENST00000476867 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
PRRX1-203ENST00000476867 WDR97A6NE52 1622 aa16.53■□□□□ 0.24
PRRX1-203ENST00000476867 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PRRX1-203ENST00000476867 SYNJ1O43426 1573 aa16.51■□□□□ 0.23
PRRX1-203ENST00000476867 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PRRX1-203ENST00000476867 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PRRX1-203ENST00000476867 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.49■□□□□ 0.23
PRRX1-203ENST00000476867 OSCARQ8IYS5 282 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRX1-203ENST00000476867 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.43■□□□□ 0.22
PRRX1-203ENST00000476867 GRIN2BQ13224 1484 aa16.42■□□□□ 0.22
PRRX1-203ENST00000476867 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.38■□□□□ 0.21
PRRX1-203ENST00000476867 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PRRX1-203ENST00000476867 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.35■□□□□ 0.21
PRRX1-203ENST00000476867 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PRRX1-203ENST00000476867 FBLN2P98095 1184 aa16.33■□□□□ 0.2
PRRX1-203ENST00000476867 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PRRX1-203ENST00000476867 SYNJ2O15056 1496 aa16.32■□□□□ 0.2
PRRX1-203ENST00000476867 PBRM1Q86U86 1689 aa16.32■□□□□ 0.2
PRRX1-203ENST00000476867 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
PRRX1-203ENST00000476867 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.3■□□□□ 0.2
PRRX1-203ENST00000476867 CHD1O14646 1710 aa16.29■□□□□ 0.2
PRRX1-203ENST00000476867 KIF27Q86VH2 1401 aa16.28■□□□□ 0.2
PRRX1-203ENST00000476867 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.26■□□□□ 0.19
PRRX1-203ENST00000476867 TRIM41Q8WV44 630 aa16.25■□□□□ 0.19
PRRX1-203ENST00000476867 CAPN15O75808 1086 aa16.23■□□□□ 0.19
PRRX1-203ENST00000476867 IGF1RP08069 1367 aa16.23■□□□□ 0.19
PRRX1-203ENST00000476867 ADAMTS12P58397 1594 aa16.21■□□□□ 0.19
PRRX1-203ENST00000476867 GRIN2AQ12879 1464 aa16.2■□□□□ 0.18
PRRX1-203ENST00000476867 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PRRX1-203ENST00000476867 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.17■□□□□ 0.18
PRRX1-203ENST00000476867 NUP160Q12769 1436 aa16.15■□□□□ 0.18
PRRX1-203ENST00000476867 CUL7Q14999 1698 aa16.12■□□□□ 0.17
PRRX1-203ENST00000476867 ARHGEF11O15085 1522 aa16.12■□□□□ 0.17
PRRX1-203ENST00000476867 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.12■□□□□ 0.17
PRRX1-203ENST00000476867 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PRRX1-203ENST00000476867 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.1■□□□□ 0.17
PRRX1-203ENST00000476867 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.1■□□□□ 0.17
PRRX1-203ENST00000476867 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.1■□□□□ 0.17
PRRX1-203ENST00000476867 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRX1-203ENST00000476867 CEP170Q5SW79 1584 aa16.09■□□□□ 0.17
PRRX1-203ENST00000476867 POLA2Q14181 598 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRX1-203ENST00000476867 JPH4Q96JJ6 628 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRX1-203ENST00000476867 DSG3P32926 999 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRX1-203ENST00000476867 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.01■□□□□ 0.15
PRRX1-203ENST00000476867 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.01■□□□□ 0.15
PRRX1-203ENST00000476867 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.01■□□□□ 0.15
PRRX1-203ENST00000476867 SHROOM2Q13796 1616 aa16■□□□□ 0.15
PRRX1-203ENST00000476867 EEA1Q15075 1411 aa16■□□□□ 0.15
PRRX1-203ENST00000476867 ARAP1Q96P48 1450 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRX1-203ENST00000476867 PRXQ9BXM0 1461 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRX1-203ENST00000476867 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRRX1-203ENST00000476867 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.91■□□□□ 0.14
PRRX1-203ENST00000476867 ABCB7O75027 752 aa15.9■□□□□ 0.14
PRRX1-203ENST00000476867 IQGAP2Q13576 1575 aa15.87■□□□□ 0.13
PRRX1-203ENST00000476867 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PRRX1-203ENST00000476867 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRX1-203ENST00000476867 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRX1-203ENST00000476867 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRX1-203ENST00000476867 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.83■□□□□ 0.12
PRRX1-203ENST00000476867 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.79■□□□□ 0.12
PRRX1-203ENST00000476867 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.78■□□□□ 0.12
PRRX1-203ENST00000476867 DISP1Q96F81 1524 aa15.78■□□□□ 0.12
PRRX1-203ENST00000476867 PTPRGP23470 1445 aa15.77■□□□□ 0.12
PRRX1-203ENST00000476867 KIF21BO75037 1637 aa15.77■□□□□ 0.12
PRRX1-203ENST00000476867 GOLGA3Q08378 1498 aa15.75■□□□□ 0.11
PRRX1-203ENST00000476867 KIAA0556O60303 1618 aa15.71■□□□□ 0.11
PRRX1-203ENST00000476867 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.7■□□□□ 0.1
PRRX1-203ENST00000476867 FKBP8Q14318 412 aa15.68■□□□□ 0.1
PRRX1-203ENST00000476867 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PRRX1-203ENST00000476867 UACAQ9BZF9 1416 aa15.67■□□□□ 0.1
PRRX1-203ENST00000476867 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.66■□□□□ 0.1
PRRX1-203ENST00000476867 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.66■□□□□ 0.1
PRRX1-203ENST00000476867 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PRRX1-203ENST00000476867 SAMD9Q5K651 1589 aa15.62■□□□□ 0.09
PRRX1-203ENST00000476867 ABCC2Q92887 1545 aa15.61■□□□□ 0.09
PRRX1-203ENST00000476867 MAPKBP1O60336 1514 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRX1-203ENST00000476867 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PRRX1-203ENST00000476867 P3H3Q8IVL6 736 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRX1-203ENST00000476867 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRX1-203ENST00000476867 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRX1-203ENST00000476867 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRX1-203ENST00000476867 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PRRX1-203ENST00000476867 ABCA8O94911 1581 aa15.56■□□□□ 0.08
PRRX1-203ENST00000476867 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.55■□□□□ 0.08
PRRX1-203ENST00000476867 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.53■□□□□ 0.08
PRRX1-203ENST00000476867 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.51■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.51■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 ASXL2Q76L83 1435 aa15.51■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.49■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 PROM2Q8N271 834 aa15.47■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.47■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 ATP10BO94823 1461 aa15.46■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 DIP2BQ9P265 1576 aa15.46■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 FMN1Q68DA7 1419 aa15.46■□□□□ 0.07
PRRX1-203ENST00000476867 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.46■□□□□ 0.06
PRRX1-203ENST00000476867 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.45■□□□□ 0.06
PRRX1-203ENST00000476867 SPDYE6P0CI01 402 aa15.45■□□□□ 0.06
PRRX1-203ENST00000476867 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms