RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317610.11

RTN4-201, Transcript of reticulon 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTN4, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4-201ENST00000317610 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.52■■■□□ 2
RTN4-201ENST00000317610 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.51■■□□□ 1.99
RTN4-201ENST00000317610 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.5■■□□□ 1.99
RTN4-201ENST00000317610 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.49■■□□□ 1.99
RTN4-201ENST00000317610 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
RTN4-201ENST00000317610 WDR97A6NE52 1622 aa27.42■■□□□ 1.98
RTN4-201ENST00000317610 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.38■■□□□ 1.97
RTN4-201ENST00000317610 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.97
RTN4-201ENST00000317610 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.34■■□□□ 1.97
RTN4-201ENST00000317610 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.34■■□□□ 1.97
RTN4-201ENST00000317610 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.967e-8■■■■■ 28.3
RTN4-201ENST00000317610 KCNH8Q96L42 1107 aa27.3■■□□□ 1.96
RTN4-201ENST00000317610 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
RTN4-201ENST00000317610 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.28■■□□□ 1.96
RTN4-201ENST00000317610 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.28■■□□□ 1.96
RTN4-201ENST00000317610 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.26■■□□□ 1.95
RTN4-201ENST00000317610 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.26■■□□□ 1.95
RTN4-201ENST00000317610 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.25■■□□□ 1.95
RTN4-201ENST00000317610 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
RTN4-201ENST00000317610 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.24■■□□□ 1.95
RTN4-201ENST00000317610 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.24■■□□□ 1.95
RTN4-201ENST00000317610 CUL7Q14999 1698 aa27.23■■□□□ 1.95
RTN4-201ENST00000317610 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.23■■□□□ 1.95
RTN4-201ENST00000317610 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.22■■□□□ 1.95
RTN4-201ENST00000317610 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
RTN4-201ENST00000317610 P3H3Q8IVL6 736 aa27.16■■□□□ 1.94
RTN4-201ENST00000317610 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
RTN4-201ENST00000317610 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.14■■□□□ 1.93
RTN4-201ENST00000317610 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.13■■□□□ 1.93
RTN4-201ENST00000317610 CCER2I3L3R5 266 aa27.13■■□□□ 1.93
RTN4-201ENST00000317610 TOPBP1Q92547 1522 aa27.13■■□□□ 1.93
RTN4-201ENST00000317610 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.11■■□□□ 1.93
RTN4-201ENST00000317610 FMN1Q68DA7 1419 aa27.11■■□□□ 1.93
RTN4-201ENST00000317610 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
RTN4-201ENST00000317610 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.06■■□□□ 1.92
RTN4-201ENST00000317610 HFM1A2PYH4 1435 aa27.06■■□□□ 1.92
RTN4-201ENST00000317610 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.04■■□□□ 1.92
RTN4-201ENST00000317610 UACAQ9BZF9 1416 aa27.04■■□□□ 1.92
RTN4-201ENST00000317610 SAMD9Q5K651 1589 aa27.03■■□□□ 1.92
RTN4-201ENST00000317610 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27■■□□□ 1.91
RTN4-201ENST00000317610 PTPRKQ15262 1439 aa27■■□□□ 1.91
RTN4-201ENST00000317610 ANP32CO43423 234 aa26.99■■□□□ 1.91
RTN4-201ENST00000317610 TONSLQ96HA7 1378 aa26.99■■□□□ 1.91
RTN4-201ENST00000317610 FKBP8Q14318 412 aa26.99■■□□□ 1.91
RTN4-201ENST00000317610 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
RTN4-201ENST00000317610 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.96■■□□□ 1.91
RTN4-201ENST00000317610 GRIN2BQ13224 1484 aa26.94■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 NAIPQ13075 1403 aa26.93■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.93■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.92■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 NCOA2Q15596 1464 aa26.92■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.92■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 BCANQ96GW7 911 aa26.9■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.89■■□□□ 1.9
RTN4-201ENST00000317610 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.88■■□□□ 1.89
RTN4-201ENST00000317610 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.87■■□□□ 1.89
RTN4-201ENST00000317610 NEFLP07196 543 aa26.87■■□□□ 1.89
RTN4-201ENST00000317610 NESP48681 1621 aa26.87■■□□□ 1.89
RTN4-201ENST00000317610 ARHGEF11O15085 1522 aa26.86■■□□□ 1.89
RTN4-201ENST00000317610 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
RTN4-201ENST00000317610 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.84■■□□□ 1.89
RTN4-201ENST00000317610 TRIM52Q96A61 297 aa26.83■■□□□ 1.89
RTN4-201ENST00000317610 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.81■■□□□ 1.88
RTN4-201ENST00000317610 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.8■■□□□ 1.88
RTN4-201ENST00000317610 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
RTN4-201ENST00000317610 HECW1Q76N89 1606 aa26.78■■□□□ 1.88
RTN4-201ENST00000317610 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.77■■□□□ 1.88
RTN4-201ENST00000317610 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.74■■□□□ 1.87
RTN4-201ENST00000317610 AKNAQ7Z591 1439 aa26.74■■□□□ 1.87
RTN4-201ENST00000317610 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
RTN4-201ENST00000317610 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
RTN4-201ENST00000317610 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
RTN4-201ENST00000317610 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.62■■□□□ 1.85
RTN4-201ENST00000317610 KDM6BO15054 1643 aa26.6■■□□□ 1.85
RTN4-201ENST00000317610 MIA2Q96PC5 1412 aa26.6■■□□□ 1.85
RTN4-201ENST00000317610 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
RTN4-201ENST00000317610 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
RTN4-201ENST00000317610 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.57■■□□□ 1.84
RTN4-201ENST00000317610 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
RTN4-201ENST00000317610 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.56■■□□□ 1.84
RTN4-201ENST00000317610 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.55■■□□□ 1.84
RTN4-201ENST00000317610 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.843e-6■□□□□ 10
RTN4-201ENST00000317610 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.849e-7■■■■□ 19.9
RTN4-201ENST00000317610 IQGAP2Q13576 1575 aa26.53■■□□□ 1.84
RTN4-201ENST00000317610 PBRM1Q86U86 1689 aa26.52■■□□□ 1.84
RTN4-201ENST00000317610 WDR62O43379 1518 aa26.51■■□□□ 1.83
RTN4-201ENST00000317610 NCOA1Q15788 1441 aa26.5■■□□□ 1.83
RTN4-201ENST00000317610 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.49■■□□□ 1.83
RTN4-201ENST00000317610 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.49■■□□□ 1.83
RTN4-201ENST00000317610 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.48■■□□□ 1.83
RTN4-201ENST00000317610 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
RTN4-201ENST00000317610 ADAMTS12P58397 1594 aa26.45■■□□□ 1.82
RTN4-201ENST00000317610 ROCK1Q13464 1354 aa26.44■■□□□ 1.82
RTN4-201ENST00000317610 CCDC7Q96M83 1385 aa26.44■■□□□ 1.82
RTN4-201ENST00000317610 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.43■■□□□ 1.82
RTN4-201ENST00000317610 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RTN4-201ENST00000317610 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
RTN4-201ENST00000317610 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.41■■□□□ 1.82
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