RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297071.8

TRA2A-201, Transcript of transformer 2 alpha homolog, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRA2A, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2A-201ENST00000297071 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.59■■■□□ 2.01
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TRA2A-201ENST00000297071 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.55■■■□□ 2
TRA2A-201ENST00000297071 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 21e-7■■□□□ 12.6
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TRA2A-201ENST00000297071 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.982e-7■■□□□ 14.5
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TRA2A-201ENST00000297071 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
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TRA2A-201ENST00000297071 TOPBP1Q92547 1522 aa27■■□□□ 1.91
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TRA2A-201ENST00000297071 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.95■■□□□ 1.91
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TRA2A-201ENST00000297071 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.89■■□□□ 1.9
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TRA2A-201ENST00000297071 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.87■■□□□ 1.89
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TRA2A-201ENST00000297071 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.85■■□□□ 1.89
TRA2A-201ENST00000297071 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.85■■□□□ 1.89
TRA2A-201ENST00000297071 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
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TRA2A-201ENST00000297071 P3H3Q8IVL6 736 aa26.8■■□□□ 1.88
TRA2A-201ENST00000297071 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TRA2A-201ENST00000297071 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.78■■□□□ 1.88
TRA2A-201ENST00000297071 BCANQ96GW7 911 aa26.78■■□□□ 1.88
TRA2A-201ENST00000297071 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TRA2A-201ENST00000297071 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TRA2A-201ENST00000297071 TRIM52Q96A61 297 aa26.71■■□□□ 1.87
TRA2A-201ENST00000297071 MIA2Q96PC5 1412 aa26.65■■□□□ 1.86
TRA2A-201ENST00000297071 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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TRA2A-201ENST00000297071 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.65■■□□□ 1.86
TRA2A-201ENST00000297071 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.64■■□□□ 1.86
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TRA2A-201ENST00000297071 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.63■■□□□ 1.85
TRA2A-201ENST00000297071 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.61■■□□□ 1.85
TRA2A-201ENST00000297071 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.56■■□□□ 1.84
TRA2A-201ENST00000297071 NCOA1Q15788 1441 aa26.55■■□□□ 1.84
TRA2A-201ENST00000297071 NESP48681 1621 aa26.54■■□□□ 1.84
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TRA2A-201ENST00000297071 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TRA2A-201ENST00000297071 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.848e-8■□□□□ 9
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TRA2A-201ENST00000297071 PBRM1Q86U86 1689 aa26.51■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 KDM6BO15054 1643 aa26.5■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 ROCK1Q13464 1354 aa26.5■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 IQGAP2Q13576 1575 aa26.48■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 WDR62O43379 1518 aa26.47■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.46■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 CCDC7Q96M83 1385 aa26.46■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
TRA2A-201ENST00000297071 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.43■■□□□ 1.82
TRA2A-201ENST00000297071 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.41■■□□□ 1.82
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